Geeni
PAX2
paired box 2
- HGNC 8616↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000075891↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5076↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 10q24.31
- Koordinaatit
- Kromosomi 10: 100 745 582–100 829 944 (GRCh38)
- Eksonit
- 10 eksonia 84,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 394 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- PAX-2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000355243.8NM_000278.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PAX2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Munuaisten ja virtsateiden synnynnäiset poikkeavuudet
- Munuaisten kolobooma-oireyhtymäAutosomaalinen dominantti
PAX2-geeniin liittyvä tila, jossa yhdistyvät munuaisten epämuodostuma ja näköhermon vauriot.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tieto johtaa silmätutkimukseen ja munuaisten toiminnan seurantaan.
Fokaalinen segmentaalinen glomeruloskleroosi
Munuaissairaus, jolle on ominaista glomeruluksissa esiintyvät skleroottiset muutokset. Syitä ovat lääkkeet, virukset ja pahanlaatuiset kasvaimet (lymfoomat), tai syy voi olla tuntematon (idiopaattinen). Se ilmenee oireettomana proteinuriana tai nefriittisenä oireyhtymänä ja voi johtaa munuaisten vajaatoimintaan.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Glomeruloskleroosi
Munuaisen glomerulus eli verisuodatin kovettuu arpeutuneiden verisuonten vuoksi.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
PAX2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,2 kb geenin 84,4 kb:stä; 1 185 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PAX2
85
PAX2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 84,4 kb geenistä PAX2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,2 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ACTN4actinin alpha 4Yhteisiä sairauksia: 2
- ANLNanillin, actin binding proteinYhteisiä sairauksia: 2
- CRB2crumbs cell polarity complex component 2Yhteisiä sairauksia: 2
- FAT1FAT atypical cadherin 1Yhteisiä sairauksia: 2
- INF2inverted formin 2Yhteisiä sairauksia: 2
- MYO1Emyosin IEYhteisiä sairauksia: 2
- TRPC6transient receptor potential cation channel subfamily C member 6Yhteisiä sairauksia: 2
Geeniin PAX2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PAX2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PAX2-geeni: paired box 2. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pax2
Dante Labs. PAX2-geeni: paired box 2 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pax2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa