Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

KAZALD1

Kazal type serine peptidase inhibitor domain 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
10q24.31
Koordinaatit
Kromosomi 10: 101 061 989–101 067 059 (GRCh38)
Eksonit
5 eksonia 5,1 kb:n alueella
Proteiini
304 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FKSG40, FKSG28
MANE Select -transkripti
ENST00000370200.6NM_030929.5
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä KAZALD1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

KAZALD1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 10, jossa hakasulke osoittaa KAZALD1-geenin sijainnin. KAZALD1 ja 12 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 10, välillä 100 564 524–101 564 523.Kromosomi 1010q24.31p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3100,6 Mb100,8 Mb101 Mb101,2 Mb101,4 MbHIF1AN: 100 529 072–100 681 896, juoste eteenpäinHIF1ANPAX2: 100 735 380–100 829 944, juoste eteenpäinPAX2SLF2: 100 912 963–100 965 134, juoste eteenpäinSLF2MRPL43: 100 968 131–100 990 450, juoste taaksepäinMRPL43SEMA4G: 100 969 493–100 985 871, juoste eteenpäinTWNK: 100 987 367–100 994 403, juoste eteenpäinTWNKLZTS2: 100 996 539–101 007 852, juoste eteenpäinLZTS2PDZD7: 101 007 679–101 032 295, juoste taaksepäinPDZD7SFXN3: 101 031 229–101 041 244, juoste eteenpäinSFXN3KAZALD1: 101 061 989–101 067 059, juoste eteenpäinKAZALD1TLX1: 101 131 011–101 137 789, juoste eteenpäinTLX1LBX1: 101 226 180–101 230 401, juoste taaksepäinLBX1BTRC: 101 354 030–101 557 324, juoste eteenpäinBTRCKAZALD1-kaavio: 5 eksonia kromosomin 10 juosteella, eteenpäinEkson 1: 101 061 989–101 062 115, 127 emästäEkson 2: 101 062 542–101 063 103, 562 emästäEkson 3: 101 064 261–101 064 421, 161 emästäEkson 4: 101 064 501–101 064 648, 148 emästäEkson 5: 101 064 826–101 067 059, 2 234 emästä123455′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,2 kb geenin 5,1 kb:stä; 915 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

KAZALD1-geenin sekvensointi

9Helppo

Kuinka vaikea KAZALD1-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki KAZALD1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa KAZALD1-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot2,7 %
  • GC-pitoisuus40 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). KAZALD1-geeni: Kazal type serine peptidase inhibitor domain 1. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/kazald1

Vancouver

Dante Labs. KAZALD1-geeni: Kazal type serine peptidase inhibitor domain 1 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/kazald1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test