Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

VARS1

valyl-tRNA synthetase 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
6p21.33
Koordinaadid
Kromosoom 6: 31 777 518–31 795 752 (GRCh38)
Eksonid
30 eksonit, ulatus 18,2 kb
Valk
1264 aminohapet
Varasemad tähised
VARS2, VARS
MANE Select transkript
ENST00000375663.8NM_006295.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni VARS1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas VARS1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 6, millel on sulg kohal, kus asub VARS1. VARS1 ja sellele lähedal asuvad 69 geeni kromosoomil 6, vahemikus 31 286 635 kuni 32 286 634.Kromosoom 66p21.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 MbHLA-B: 31 353 195–31 367 067, pöördne ahelHLA-BMICA: 31 399 784–31 415 315, otsene ahelMICAMICB: 31 494 881–31 511 124, otsene ahelMICBMCCD1: 31 528 962–31 530 232, otsene ahelMCCD1DDX39B: 31 530 217–31 542 451, pöördne ahelDDX39BATP6V1G2-DDX39B: 31 530 219–31 546 608, pöördne ahelATP6V1G2: 31 544 444–31 548 427, pöördne ahelNFKBIL1: 31 546 870–31 558 829, otsene ahelLTA: 31 572 054–31 574 324, otsene ahelTNF: 31 575 558–31 578 336, otsene ahelTNFLTB: 31 580 525–31 582 522, pöördne ahelLST1: 31 581 065–31 588 911, otsene ahelLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, pöördne ahelNCR3AIF1: 31 615 214–31 617 025, otsene ahelAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, otsene ahelPRRC2A: 31 622 774–31 622 860, otsene ahel: 31 623 874–31 625 499, otsene ahelBAG6: 31 638 543–31 652 747, pöördne ahelAPOM: 31 652 416–31 658 214, otsene ahelC6orf47: 31 658 298–31 660 778, pöördne ahelGPANK1: 31 661 228–31 666 283, pöördne ahelCSNK2B: 31 665 227–31 670 343, otsene ahel: 31 666 102–31 673 546, otsene ahelLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, otsene ahelLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, pöördne ahelLY6G5CABHD16A: 31 686 954–31 703 391, pöördne ahelABHD16ALY6G6F: 31 706 863–31 710 801, otsene ahelLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, otsene ahelLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, otsene ahelMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, otsene ahelLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, pöördne ahelDDAH2: 31 726 586–31 730 617, pöördne ahelCLIC1: 31 730 579–31 740 558, pöördne ahelMSH5: 31 739 677–31 762 678, otsene ahelMSH5MSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, otsene ahelSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, otsene ahelSAPCD1VWA7: 31 765 590–31 777 328, pöördne ahelVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 752, pöördne ahelVARS1LSM2: 31 797 019–31 806 992, pöördne ahelLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, pöördne ahelHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, otsene ahelHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, otsene ahelHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, pöördne ahelNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, pöördne ahelSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, pöördne ahelEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, otsene ahelC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, pöördne ahelZBTB12: 31 927 698–31 952 048, otsene ahelCFB: 31 945 650–31 952 086, otsene ahelCFBNELFE: 31 952 087–31 959 079, pöördne ahelSKIC2: 31 959 025–31 969 852, otsene ahelSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, pöördne ahelWHR1: 31 971 091–31 982 821, otsene ahelC4A: 31 981 991–32 005 247, otsene ahelC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, otsene ahelC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, otsene ahelCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 115 334, pöördne ahelTNXBATF6B: 32 115 264–32 128 255, pöördne ahelATF6BFKBPL: 32 128 697–32 131 070, pöördne ahelFKBPLPPT2: 32 146 580–32 163 679, otsene ahelPRRT1: 32 147 292–32 153 083, pöördne ahelPRRT1: 32 150 495–32 154 373, pöördne ahelPPT2-EGFL8: 32 153 845–32 171 978, otsene ahelEGFL8: 32 163 918–32 171 980, otsene ahelAGPAT1: 32 167 118–32 178 112, pöördne ahelRNF5: 32 178 391–32 184 769, otsene ahelAGER: 32 180 963–32 184 365, pöördne ahelPBX2: 32 184 733–32 190 278, pöördne ahelGPSM3: 32 190 766–32 195 523, pöördne ahelNOTCH4: 32 194 843–32 224 111, pöördne ahelNOTCH4VARS1 skeem: 30 eksonit kromosoomi 6 pöördne ahelalEkson 29: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 28: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 27: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 25: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 20: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 13: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 2: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 30: 31 777 518–31 777 662, 145 alustEkson 29: 31 778 967–31 779 292, 326 alustEkson 28: 31 779 425–31 779 536, 112 alustEkson 27: 31 779 608–31 779 814, 207 alustEkson 26: 31 779 998–31 780 153, 156 alustEkson 25: 31 780 441–31 780 568, 128 alustEkson 24: 31 780 705–31 780 783, 79 alustEkson 23: 31 780 870–31 780 938, 69 alustEkson 22: 31 781 019–31 781 123, 105 alustEkson 21: 31 781 481–31 781 606, 126 alustEkson 20: 31 781 691–31 781 761, 71 alustEkson 19: 31 781 847–31 781 952, 106 alustEkson 18: 31 782 087–31 782 177, 91 alustEkson 17: 31 782 285–31 782 443, 159 alustEkson 16: 31 782 530–31 782 633, 104 alustEkson 15: 31 782 721–31 782 845, 125 alustEkson 14: 31 783 096–31 783 186, 91 alustEkson 13: 31 784 214–31 784 308, 95 alustEkson 12: 31 784 394–31 784 502, 109 alustEkson 11: 31 784 595–31 784 714, 120 alustEkson 10: 31 785 246–31 785 327, 82 alustEkson 9: 31 785 569–31 785 733, 165 alustEkson 8: 31 791 610–31 791 737, 128 alustEkson 7: 31 791 871–31 791 971, 101 alustEkson 6: 31 792 217–31 792 301, 85 alustEkson 5: 31 792 392–31 792 516, 125 alustEkson 4: 31 792 757–31 792 895, 139 alustEkson 3: 31 792 986–31 793 120, 135 alustEkson 2: 31 794 831–31 795 250, 420 alustEkson 1: 31 795 546–31 795 752, 207 alust3025201510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,1 kb kogupikkusega 18,2 kb; neist 3795 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse VARS1

25

kohad geenis VARS1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist 25 (100%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

  • MHC (25 kohta)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni VARS1 18,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,1 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). VARS1 geen: valyl-tRNA synthetase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/vars1

Vancouver

Dante Labs. VARS1 geen: valyl-tRNA synthetase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/vars1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test