Geen
PEX1
peroxisomal biogenesis factor 1
- HGNC 8850↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000127980↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 5189↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 7q21.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 7: 92 487 025–92 528 520 (GRCh38)
- Eksonid
- 24 eksonit, ulatus 41,5 kb
- Valk
- 1283 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Varasemad tähised
- ZWS1, ZWS
- MANE Select transkript
- ENST00000248633.9NM_000466.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PEX1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Zellwegeri spektri ja peroksisoomide biogeneesi häired
- Peroksisoomide biogeneesi häired (Zellwegeri spekter ja rhizomelne kondrodüsplaasia punktaat)Autosoomne retsessiivne
Muutused mis tahes enam kui tosinas PEX-geenis, kõige sagedamini PEX1-s, mõjutavad aju, maksa, neerusid, luid, silmi ja kuulmist. Raskusaste ulatub elu piiravast haigusest imikueas kuni kergemate nägemis-, kuulmis- ja õppimisraskusteni.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 7 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Diagnoos suunab maksa, neerupealiste, nägemise ja kuulmise talitluse jälgimist, vajadusel toidulisandite kasutamist ning sugulaste kandjatesti.
Laiemad rühmad
Ostale pärilikud leukodüstroofiad
- Leukodüstroofia (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 80 sellega seotud geenist
Pärilikud seisundid, mis kahjustavad või takistavad müeliini, aju ja seljaaju valgeaine, normaalset moodustumist. Erinevad tüübid päranduvad autosoomselt retsessiivselt, autosoomselt dominantselt või X-seotult, sõltuvalt asjaomasest geenist.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 7 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Konkreetse geneetilise põhjuse teadmine võib lõpetada diagnostilise otsingu, suunata toetavat ravi ja jälgimist, näidata, kas konkreetne ravi on olemas, ning võimaldada sugulaste testimist.
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas PEX1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,4 kb kogupikkusega 41,5 kb; neist 3852 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PEX1
397
kohad geenis PEX1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PEX1 41,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,4 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- PEX10peroxisomal biogenesis factor 10Jagab 2 haigust
- PEX11Bperoxisomal biogenesis factor 11 betaJagab 2 haigust
- PEX12peroxisomal biogenesis factor 12Jagab 2 haigust
- PEX13peroxisomal biogenesis factor 13Jagab 2 haigust
- PEX14peroxisomal biogenesis factor 14Jagab 2 haigust
- PEX16peroxisomal biogenesis factor 16Jagab 2 haigust
- PEX19peroxisomal biogenesis factor 19Jagab 2 haigust
- PEX2peroxisomal biogenesis factor 2Jagab 2 haigust
- PEX26peroxisomal biogenesis factor 26Jagab 2 haigust
- PEX3peroxisomal biogenesis factor 3Jagab 2 haigust
- PEX5peroxisomal biogenesis factor 5Jagab 2 haigust
- PEX6peroxisomal biogenesis factor 6Jagab 2 haigust
Geeniga PEX1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PEX1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of head or neck
- Amelogenesis imperfecta
- Cleft palate
- Depressed nasal bridge
- Little lower jaw
- Prominent forehead
- Thin dental enamel
- Triangular face
- Wider-than-typical soft spot of skull
Näita veel 35 tunnust
- Abnormal dentition
- Abnormal nasolacrimal system morphology
- Abnormal tooth enamel
- Abnormality of the eyebrow
- Abnormality of the eyelid
- Abnormality of the palate
- Eye folds
- Flat face
- High forehead
- Long, narrow head
- Nasal tip, upturned
- Taurodontia
- Thin eyebrow
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide nasal bridge
- Abnormally small head
- Big calvaria
- Flat back of skull
- Flattened bony protrusion above eyes
- High palate
- Round face
- Abnormality of the face
- Abnormality of the tongue
- Bell's palsy
- High frontal hairline
- Thickened skin folds of neck
- Abnormally large tongue
- Beaked nose
- High, narrow palate
- High, prominent forehead
- Midface retrusion
- Protruding tongue
- Redundant neck skin
- Widely patent fontanelles and sutures
- Zygomatic flattening
Abnormality of the nervous system
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed speech and language development
- Focal clonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Global developmental delay
- More grooves in brain
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Ventriculomegaly
Näita veel 25 tunnust
- Abnormality of movement
- Cognitive impairment
- Diminished deep tendon reflex
- EEG abnormality
- Epilepsy
- Increased reflexes
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Profound global developmental delay
- Severe global developmental delay
- Abnormality of neuronal migration
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Loss of ability to walk
- Unsteady walk
- Damage to nerves that sense feeling
- Decreased reflex response
- Peripheral neuropathy
- Absent reflexes
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Gray matter heterotopia
- Hypoplastic olfactory lobes
- Intellectual disability, severe
- Leukodystrophy
- Subependymal cysts
Abnormality of the eye
- Horizontal nystagmus
- Wide-set eyes
- Corneal opacity
- Cross-eyed
- Difficulties with night vision
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Limited peripheral vision
- Optic atrophy
Näita veel 15 tunnust
- Rod-cone dystrophy
- Visual impairment
- Abnormal chorioretinal morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Clouding of the lens of the eye
- Drooping upper eyelid
- Posterior embryotoxon
- Retinal pigment epithelial mottling
- Glaucoma
- Macular dystrophy
- Speckled iris
- Abnormal electroretinogram
- Opacification of the corneal stroma
- Optic disc pallor
- Pigmentary retinopathy
Abnormality of the genitourinary system
- Underdevelopment of external reproductive organs
- Enlarged clitoris
- Hydronephrosis
- Hypospadias
- Multicystic kidney dysplasia
- Primary amenorrhea
- Undescended testes
- Cystic kidney disease
Näita veel 1 tunnus
Abnormality of the integument
- Abnormal fingernails
- Abnormal hair quantity
- Abnormality of nail color
- Abnormality of the toenail
- Flattened and twisted hair
- Beau's lines
- Darkened and thickened skin
- Ichthyosis
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PEX1 geen: peroxisomal biogenesis factor 1. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pex1
Dante Labs. PEX1 geen: peroxisomal biogenesis factor 1 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pex1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast