Gen
SLC6A1
solute carrier family 6 member 1
- HGNC 11042↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000157103↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 6529↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 3p25.3
- Coordenadas
- Cromosoma 3: 10.992.748–11.039.247 (GRCh38)
- Exones
- 16 exones en 46,5 kb
- Proteína
- 599 aminoácidos
- También conocido como
- GAT1, GABATR, GABATHG, GAT-1, hGAT-1
- Transcrito MANE Select
- ENST00000287766.10NM_003042.4
- Tipo de locus
- Protein-coding
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Epilepsia (panel completo)
- Epilepsia
Uno de 171 genes relacionados con ello
Un trastorno cerebral caracterizado por episodios de descargas neuronales anormalmente elevadas que provocan episodios transitorios de disfunción neurológica sensitiva o motora, o disfunción psíquica. Estos episodios pueden asociarse o no a pérdida de consciencia o convulsiones.
- 5 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
Estructura de SLC6A1
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 4,5 kb de los 46,5 kb del gen; 1800 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de SLC6A1
121
posiciones en SLC6A1 en las que ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultades para analizar.
Un genoma completo cubre los 46,5 kb de SLC6A1, incluidos los intrones, y no solo los 4,5 kb de exones.
Genes vinculados a las mismas afecciones
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Comparte 1 afección
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseComparte 1 afección
- ACTL6Bactin like 6BComparte 1 afección
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Comparte 1 afección
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Comparte 1 afección
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitComparte 1 afección
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Comparte 1 afección
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Comparte 1 afección
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorComparte 1 afección
- ARXaristaless related homeoboxComparte 1 afección
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Comparte 1 afección
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Comparte 1 afección
Rasgos asociados a SLC6A1
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que SLC6A1 puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of the nervous system
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Intellectual disability
- Brief seizures with staring spells
- EEG with focal spike waves
- Global developmental delay
- Motor delay
- Absent speech development
- Attention deficit
Mostrar 29 rasgos más
- Autism spectrum disorder
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Delayed speech and language development
- EEG with polyspike wave complexes
- Eyelid myoclonus
- Generalized myoclonic seizure
- Lack of peer relationships
- More active than typical
- Repetitive movements
- Sudden loss of muscle tone
- Abnormal emotional state
- Abnormal thalamus morphology
- Ataxia
- Brain imaging abnormality
- Cerebral white matter atrophy
- Delayed CNS myelination
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- Grand mal seizures
- Interictal epileptiform activity
- Myoclonic seizure
- Poor social interactions
- Simple febrile seizure
- Tremor
- Abnormal pyramidal sign
- Epileptic encephalopathy
- Seizure affecting one half of brain
- Unsteady walk
- Epileptic spasm
Abnormality of head or neck
- Deep philtrum
- Depressed nasal bridge
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Prominent nose
- Big lower jaw
- Broad head shape
- Cleft palate
- Downturned corners of mouth
Mostrar 17 rasgos más
- Eye folds
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Narrow forehead
- Narrow opening between the eyelids
- Nasal tip, upturned
- Short philtrum
- Thin red part of the upper lip
- Abnormal facial shape
- Abnormally small head
- Broad philtrum
- Full lower lip
- Long philtrum
- Prominent forehead
- Thick nasal alae
- Wide mouth
- Wide nasal bridge
Abnormality of limbs
- Acromesomelia
- Attachment of thumb close to wrist
- Broad big toe
- Broad thumb
- Inability to straighten knee
- Overlapping toe
- Postaxial polydactyly
- Tapered finger
Mostrar 2 rasgos más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-17: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.17-8666dff2.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen SLC6A1: solute carrier family 6 member 1. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/slc6a1
Dante Labs. Gen SLC6A1: solute carrier family 6 member 1 [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/slc6a1
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