Genas
SLC6A1
solute carrier family 6 member 1
- HGNC 11042↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000157103↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6529↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 3p25.3
- Koordinatės
- Chromosoma 3: 10 992 748–11 039 247 (GRCh38)
- Eksonai
- 16 eksonų per 46,5 kb
- Baltymas
- 599 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- GAT1, GABATR, GABATHG, GAT-1, hGAT-1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000287766.10NM_003042.4
- Lokuso tipas
- Protein-coding
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc6a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite SLC6A1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Epilepsija (pilnas tyrimas)
- Epilepsija
Susijusi su 171 genu
Smegenų sutrikimas, pasireiškiantis epizodais, kai neuronai nenormaliai intensyviai išsikrauna, dėl ko atsiranda trumpalaikiai jutimo ar judesio neurologinio funkcijos sutrikimo arba psichikos funkcijos sutrikimo epizodai. Šie epizodai gali būti susiję arba nesusiję su sąmonės netekimu ar traukuliais.
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas SLC6A1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,5 kb iš 46,5 kb geno; 1 800 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: SLC6A1
121
vieta geno SLC6A1 sekoje, kurioje ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurioje trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 46,5 kb geno SLC6A1, įskaitant intronus, o ne tik 4,5 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Turi 1 bendrą būklę
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ACTL6Bactin like 6BTuri 1 bendrą būklę
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Turi 1 bendrą būklę
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Turi 1 bendrą būklę
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitTuri 1 bendrą būklę
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Turi 1 bendrą būklę
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Turi 1 bendrą būklę
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorTuri 1 bendrą būklę
- ARXaristaless related homeoboxTuri 1 bendrą būklę
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Turi 1 bendrą būklę
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su SLC6A1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SLC6A1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Intellectual disability
- Brief seizures with staring spells
- EEG with focal spike waves
- Global developmental delay
- Motor delay
- Absent speech development
- Attention deficit
Rodyti dar 29 savybių
- Autism spectrum disorder
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Delayed speech and language development
- EEG with polyspike wave complexes
- Eyelid myoclonus
- Generalized myoclonic seizure
- Lack of peer relationships
- More active than typical
- Repetitive movements
- Sudden loss of muscle tone
- Abnormal emotional state
- Abnormal thalamus morphology
- Ataxia
- Brain imaging abnormality
- Cerebral white matter atrophy
- Delayed CNS myelination
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- Grand mal seizures
- Interictal epileptiform activity
- Myoclonic seizure
- Poor social interactions
- Simple febrile seizure
- Tremor
- Abnormal pyramidal sign
- Epileptic encephalopathy
- Seizure affecting one half of brain
- Unsteady walk
- Epileptic spasm
Abnormality of head or neck
- Deep philtrum
- Depressed nasal bridge
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Prominent nose
- Big lower jaw
- Broad head shape
- Cleft palate
- Downturned corners of mouth
Rodyti dar 17 savybių
- Eye folds
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Narrow forehead
- Narrow opening between the eyelids
- Nasal tip, upturned
- Short philtrum
- Thin red part of the upper lip
- Abnormal facial shape
- Abnormally small head
- Broad philtrum
- Full lower lip
- Long philtrum
- Prominent forehead
- Thick nasal alae
- Wide mouth
- Wide nasal bridge
Abnormality of limbs
- Acromesomelia
- Attachment of thumb close to wrist
- Broad big toe
- Broad thumb
- Inability to straighten knee
- Overlapping toe
- Postaxial polydactyly
- Tapered finger
Rodyti dar 2 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SLC6A1 genas: solute carrier family 6 member 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/slc6a1
Dante Labs. SLC6A1 genas: solute carrier family 6 member 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/slc6a1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites