Gen
SLC6A1
solute carrier family 6 member 1
- HGNC 11042↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000157103↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6529↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 3p25.3
- Współrzędne
- Chromosom 3: 10 992 748–11 039 247 (GRCh38)
- Eksony
- 16 eksonów na odcinku 46,5 kb
- Białko
- 599 aminokwasów
- Znany również jako
- GAT1, GABATR, GABATHG, GAT-1, hGAT-1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000287766.10NM_003042.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj SLC6A1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Padaczka (pełny panel)
- Padaczka
Jeden z 171 powiązanych z nim genów
Zaburzenie mózgu charakteryzujące się epizodami nieprawidłowo nasilonej aktywności wyładowań neuronalnych, które prowadzą do przejściowych zaburzeń czuciowych lub ruchowych albo zaburzeń psychicznych. Epizodom tym może, ale nie musi, towarzyszyć utrata przytomności lub drgawki.
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Budowa genu SLC6A1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,5 kb z 46,5 kb genu; 1800 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje SLC6A1
121
pozycje w SLC6A1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 46,5 kb genu SLC6A1, łącznie z intronami, a nie tylko 4,5 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseWspólne schorzenie: 1
- ACTL6Bactin like 6BWspólne schorzenie: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Wspólne schorzenie: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Wspólne schorzenie: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitWspólne schorzenie: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Wspólne schorzenie: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Wspólne schorzenie: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorWspólne schorzenie: 1
- ARXaristaless related homeoboxWspólne schorzenie: 1
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Wspólne schorzenie: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SLC6A1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SLC6A1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Intellectual disability
- Brief seizures with staring spells
- EEG with focal spike waves
- Global developmental delay
- Motor delay
- Absent speech development
- Attention deficit
Pokaż jeszcze 29 cech
- Autism spectrum disorder
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Delayed speech and language development
- EEG with polyspike wave complexes
- Eyelid myoclonus
- Generalized myoclonic seizure
- Lack of peer relationships
- More active than typical
- Repetitive movements
- Sudden loss of muscle tone
- Abnormal emotional state
- Abnormal thalamus morphology
- Ataxia
- Brain imaging abnormality
- Cerebral white matter atrophy
- Delayed CNS myelination
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- Grand mal seizures
- Interictal epileptiform activity
- Myoclonic seizure
- Poor social interactions
- Simple febrile seizure
- Tremor
- Abnormal pyramidal sign
- Epileptic encephalopathy
- Seizure affecting one half of brain
- Unsteady walk
- Epileptic spasm
Abnormality of head or neck
- Deep philtrum
- Depressed nasal bridge
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Prominent nose
- Big lower jaw
- Broad head shape
- Cleft palate
- Downturned corners of mouth
Pokaż jeszcze 17 cech
- Eye folds
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Narrow forehead
- Narrow opening between the eyelids
- Nasal tip, upturned
- Short philtrum
- Thin red part of the upper lip
- Abnormal facial shape
- Abnormally small head
- Broad philtrum
- Full lower lip
- Long philtrum
- Prominent forehead
- Thick nasal alae
- Wide mouth
- Wide nasal bridge
Abnormality of limbs
- Acromesomelia
- Attachment of thumb close to wrist
- Broad big toe
- Broad thumb
- Inability to straighten knee
- Overlapping toe
- Postaxial polydactyly
- Tapered finger
Pokaż jeszcze 2 cech
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SLC6A1: solute carrier family 6 member 1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/slc6a1
Dante Labs. Gen SLC6A1: solute carrier family 6 member 1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/slc6a1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni