Gen
NPHP3
nephrocystin 3
- HGNC 7907↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000113971↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 27031↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 3q22.1
- Souřadnice
- Chromozom 3: 132 680 609–132 722 409 (GRCh38)
- Exony
- 27 exonů na 41,8 kb
- Protein
- 1 330 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- NPH3, KIAA2000, FLJ30691, FLJ36696, MKS7, SLSN3, CFAP31
- Transkript MANE Select
- ENST00000337331.10NM_153240.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si NPHP3 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Nephronophthisis and Senior-Løken Syndrome
- Senior-Løken SyndromeAutozomálně recesivní
A form of nephronophthisis combined with retinal degeneration that can cause early vision loss.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing prompts referral for an eye examination alongside kidney monitoring.
- NephronophthisisAutozomálně recesivní
A recessively inherited kidney disease, caused by variants in NPHP1 and other cilia genes, in which progressive tubulointerstitial scarring leads to kidney failure, typically in the first three decades of life.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing allows regular kidney function monitoring, timely planning for dialysis or transplantation, and carrier testing for relatives.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je NPHP3 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,3 kb z 41,8 kb genu; 3 993 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte NPHP3
139
pozic v genu NPHP3, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 41,8 kb genu NPHP3, včetně intronů, nikoli jen 5,3 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- CEP164centrosomal protein 164Sdílí 2 onemocnění
- NPHP4nephrocystin 4Sdílí 2 onemocnění
- WDR19WD repeat domain 19Sdílí 2 onemocnění
- ADAMTS9ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9Sdílí 1 onemocnění
- ANKS6ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6Sdílí 1 onemocnění
- CEP83centrosomal protein 83Sdílí 1 onemocnění
- DCDC2doublecortin domain containing 2Sdílí 1 onemocnění
- GLIS2GLIS family zinc finger 2Sdílí 1 onemocnění
- IFT54intraflagellar transport 54Sdílí 1 onemocnění
- INVSinversinSdílí 1 onemocnění
- IQCB1IQ motif containing B1Sdílí 1 onemocnění
- MAPKBP1mitogen-activated protein kinase binding protein 1Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s NPHP3
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit NPHP3. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the digestive system
- Hyperechogenic pancreas
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Enlarged liver
- Abnormal biliary tract morphology
- Abnormal liver parenchyma morphology
- Abnormal pancreatic duct morphology
- Abnormality of the pancreas
- Biliary cirrhosis
Zobrazit ještě 13 rysů
- Intestinal malrotation
- Malformation of the hepatic ductal plate
- Neonatal cholestatic liver disease
- Pancreatic dysplasia
- Pancreatic fibrosis
- Excessive buildup of connective tissue and scarring of liver at birth
- Hepatic fibrosis
- Inguinal hernia
- Jaundice
- Liver cysts
- Pancreatic cysts
- Slowed or blocked flow of bile from liver
- Bile duct proliferation
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen NPHP3: nephrocystin 3. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/nphp3
Dante Labs. Gen NPHP3: nephrocystin 3 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/nphp3
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů