Gen
NHEJ1
non-homologous end joining factor 1
- HGNC 25737↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000187736↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 79840↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 2q35
- Souřadnice
- Chromozom 2: 219 069 357–219 160 815 (GRCh38)
- Exony
- 8 exonů na 91,5 kb
- Protein
- 299 aminokyselin
- Další názvy
- Cernunnos, XLF, FLJ12610
- Transkript MANE Select
- ENST00000356853.10NM_024782.3
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nhej1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si NHEJ1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Severe Combined Immunodeficiency
- Autozomálně recesivní
Severe combined immunodeficiency (SCID) comprises a group of rare monogenic primary immunodeficiency disorders characterized by a lack of functional peripheral T lymphocytes resulting in early-onset severe respiratory infections and failure to thrive. They are classified according to immunological phenotype into SCID with absence of T cells but presence of B cells (T-B+ SCID) or SCID with absence of both (T-B- SCID). Both of these groups include several forms, with or without natural killer (NK) cells.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 3 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 3 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Jak je NHEJ1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 8 kb z 91,5 kb genu; 900 těchto bází kódují protein.
Sekvenování NHEJ1
26
pozic v NHEJ1, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celé genomové sekvenování pokrývá všech 91,5 kb genu NHEJ1, včetně intronů, nejen 8 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ADAadenosine deaminaseSdílí 2 onemocnění
- AK2adenylate kinase 2Sdílí 2 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 2 onemocnění
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Sdílí 2 onemocnění
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Sdílí 2 onemocnění
- CD247CD247 moleculeSdílí 2 onemocnění
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexSdílí 2 onemocnění
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexSdílí 2 onemocnění
- CD70CD70 moleculeSdílí 2 onemocnění
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorSdílí 2 onemocnění
- CORO1Acoronin 1ASdílí 2 onemocnění
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CSdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s NHEJ1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit NHEJ1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Autoimmune hemolytic anemia
- Autoimmune thrombocytopenia
- Bone marrow failure
- Decreased naive T cell proportion
- Decreased total CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Erythroid hyperplasia
- Hemophagocytosis
Zobrazit ještě 14 rysů
- Increased memory T cell proportion
- Increased naive CD4+ T cell proportion
- Low B cell count
- Low T cell count
- Megakaryocyte dysplasia
- Megakaryocytopenia
- Myelodysplasia
- Decreased blood lymphocyte number
- Low platelet count
- Decreased blood leukocyte number
- High blood eosinophil count
- Low blood cell count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Reduced total natural killer cell count
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Lung abscess
- Methicillin-resistant Staphylococcus aureus infection
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent bronchitis
- Recurrent pneumonia
- Recurrent respiratory infections
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen NHEJ1: non-homologous end joining factor 1. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/nhej1
Dante Labs. Gen NHEJ1: non-homologous end joining factor 1 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/nhej1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů