Gen
CAV1
caveolin 1
- HGNC 1527↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000105974↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 857↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 7q31.2
- Koordinater
- Kromosom 7: 116 525 036–116 561 179 (GRCh38)
- Exoner
- 3 exoner på 36,1 kb
- Protein
- 178 aminosyror
- Tidigare symboler
- CAV
- MANE Select-transkript
- ENST00000341049.7NM_001753.5
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cav1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs CAV1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ärftlig pulmonell arteriell hypertension (HPAH)
- Ärftlig pulmonell arteriell hypertension
Ärftlig pulmonell arteriell hypertension (HPAH) är en form av pulmonell arteriell hypertension (PAH) som uppstår på grund av mutationer i gener som predisponerar för PAH eller i en familjär kontext. HPAH kännetecknas av ökat motstånd i lungartärerna, vilket leder till högersidig hjärtsvikt. HPAH är progressiv och kan vara dödlig.
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Lipodystrofi
- Berardinelli-Seip medfödd lipodystrofiAutosomalt recessiv
En lipodystrofi som kännetecknas av kombinationen av lipoatrofi, hypertriglyceridemi, hepatomegali och akromegaloida drag. BSCL tillhör gruppen extrema insulinresistenssyndrom, som även omfattar leprechaunism, Rabson-Mendenhalls syndrom, förvärvad generaliserad lipodystrofi samt insulinresistens typ A och B.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
- Medfödd generaliserad lipodystrofiAutosomalt recessiv
En extremt sällsynt autosomalt recessiv sjukdom, som kännetecknas av en extrem brist på fett i subkutan vävnad.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
- Familjär partiell lipodystrofi
Omfattar formerna med LMNA (Dunnigan), PPARG, PLIN1, LIPE, AKT2, CAV1 och PLAAT3, som orsakar fettförlust i armar och ben samt skinkor, tillsammans med insulinresistens, diabetes, höga triglycerider och fettlever.
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Om du känner till din variant möjliggörs tidig screening och behandling av diabetes, triglycerider och leversjukdom, och i utvalda fall metreleptin.
Så är CAV1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,5 kb av genens 36,1 kb, och 537 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av CAV1
1Låg
Hur svår CAV1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av CAV1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.3,6 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
5
positioner i CAV1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 36,1 kb av CAV1, inklusive introner, inte bara de 2,5 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AGPAT21-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2Delar 2 tillstånd
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinDelar 2 tillstånd
- AKT2AKT serine/threonine kinase 2Delar 1 tillstånd
- ATP13A3ATPase 13A3Delar 1 tillstånd
- BMPR2bone morphogenetic protein receptor type 2Delar 1 tillstånd
- CAVIN1caveolae associated protein 1Delar 1 tillstånd
- KCNK3potassium two pore domain channel subfamily K member 3Delar 1 tillstånd
- LIPElipase E, hormone sensitive typeDelar 1 tillstånd
- LMNAlamin A/CDelar 1 tillstånd
- PLAAT3phospholipase A and acyltransferase 3Delar 1 tillstånd
- PLIN1perilipin 1Delar 1 tillstånd
- PPARGperoxisome proliferator activated receptor gammaDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till CAV1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CAV1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Diarrhea
- Feeding difficulties
- Malabsorption
- Nausea and vomiting
- Poor swallowing
- Recurring pancreas inflammation
- Vomiting
Visa ytterligare 2 egenskaper
Laboratory abnormality
- Increased plasma triglycerides
- Body fails to respond to insulin
- Elevated serum cholesterol
- Fluid around lungs
- Type 1 diabetes
- Diabetes mellitus
- Fatty infiltration of liver
- Glucose intolerance
Visa ytterligare 2 egenskaper
Abnormality of head or neck
- Triangular face
- Decreased salivary flow
- Dental cavities
- Narrow mouth
- Narrow nasal ridge
- Short nose
- Sparse scalp hair
- Sunken cheeks
Visa ytterligare 1 egenskap
Abnormality of the musculoskeletal system
- Inability to make and keep healthy fat tissue
- Narrow foramen obturatorium
- Arthritis
- Breakdown of bone
- Flexed joint that cannot be straightened
- Muscle weakness
- Absent fat below the skin
- Generalized lipodystrophy
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CAV1-genen: caveolin 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/cav1
Dante Labs. CAV1-genen: caveolin 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/cav1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor