Gen
FANCA
FA complementation group A
- HGNC 3582↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000187741↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 2175↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 16q24.3
- Koordinater
- Kromosom 16: 89 737 549–89 816 647 (GRCh38)
- Eksoner
- 43 eksoner over 79,1 kb
- Protein
- 1 455 aminosyrer
- Også kjent som
- FAA, FA-H, FAH
- Tidligere symboler
- FACA, FANCH
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000389301.8NM_000135.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fanca.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes FANCA og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
DNA-reparasjonssykdom
- Autosomal recessiv
En sykdom som har sitt grunnlag i forstyrrelse av DNA-reparasjon.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 8 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Fanconi-anemi
- Autosomal recessiv
Fanconi-anemi (FA) er en arvelig DNA-reparasjonssykdom preget av progressiv pancytopeni med benmargssvikt, varierende medfødte misdannelser og økt disposisjon for hematologiske eller solide svulster.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 8 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Hematopoietisk stamcelletransplantasjon med FA-spesifikk kondisjonering med redusert intensitet; androgener (oksymetolon) som brobehandling; kreftovervåking for hode-/hals- og gynekologiske maligniteter; genterapi i kliniske studier
Slik er FANCA bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 5,5 kb av genets 79,1 kb, og 4 368 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av FANCA
708
posisjoner i FANCA der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har problemer med.
En helgenomsekvensering dekker alle 79,1 kb av FANCA, inkludert introner, ikke bare de 5,5 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (852)
The FANCA variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 475
- Patogen/sannsynligvis patogen 75
- Sannsynligvis patogen 302
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000135.4(FANCA):c.4268_*37del (p.Ala1423_Ter1456delinsXaa) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4261-2A>C (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4198C>T (p.Arg1400Cys) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4185dup (p.Ile1396fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4168-2A>G (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4130C>G (p.Ser1377Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4124_4125del (p.Thr1375fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4017_4021del (p.Ser1340fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4015del (p.Leu1339fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4010+1_4010+18del (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.4010+2T>C (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3971C>T (p.Pro1324Leu) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3934+2T>C (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3929_3932del (p.Glu1310fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3931_3932del (p.Glu1310_Ser1311insTer) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3918dup (p.Gln1307fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3919C>T (p.Gln1307Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia complementation group A | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3915_3916del (p.Phe1306fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3913C>T (p.Leu1305Phe) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3828+1G>C (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3828+1G>T (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3813dup (p.His1272fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3782TCT[2] (p.Phe1263del) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3761_3762del (p.Glu1254fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000135.4(FANCA):c.3761_3762dup (p.Glu1255fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
See all 852 with every other FANCA variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme tilstandene
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedDeler 2 tilstander
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedDeler 2 tilstander
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Deler 2 tilstander
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitDeler 2 tilstander
- FANCBFA complementation group BDeler 2 tilstander
- FANCCFA complementation group CDeler 2 tilstander
- FANCD2FA complementation group D2Deler 2 tilstander
- FANCEFA complementation group EDeler 2 tilstander
- FANCFFA complementation group FDeler 2 tilstander
- FANCGFA complementation group GDeler 2 tilstander
- FANCIFA complementation group IDeler 2 tilstander
- FANCLFA complementation group LDeler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til FANCA
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene FANCA kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Decreased blood leukocyte number
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Pyridoxine-responsive sideroblastic anemia
- Myelodysplasia
- Blood cancer
- Bruising susceptibility
Vis 3 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-18: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.18-8b139e39.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). FANCA-genet: FA complementation group A. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/fanca
Dante Labs. FANCA-genet: FA complementation group A [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/fanca
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker