Gen
DYRK1A
dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A
- HGNC 3091↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000157540↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 1859↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 21q22.13
- Koordinater
- Kromosom 21: 37 366 773–37 526 358 (GRCh38)
- Eksoner
- 12 eksoner over 159,6 kb
- Protein
- 754 aminosyrer
- Tidligere symboler
- DYRK1, DYRK, MNBH
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000647188.2NM_001347721.2
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dyrk1a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes DYRK1A og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Intellektuell funksjonsnedsettelse
Ett av 233 gener knyttet til den
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er DYRK1A bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 17 kb av genets 159,6 kb, og 2 265 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av DYRK1A
3Lett
Hvor vanskelig DYRK1A er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til DYRK1A ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.
Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til DYRK1A i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en variant der kan mangle eller være feil. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 100.0,3 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale områdene og det X-transponerte området, der chrX og chrY har samme eller nesten samme sekvens, slik at en lesing fra den ene kan plasseres på den andre. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- ReferansedekningHull i referanseassemblyen i nærheten, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 50.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 30.5,4 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 20.6,4 %
En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbasene til DYRK1A i den typen vanskelig område. Hver enkelt type kan gjøre et gen vanskelig alene, og hver ekstra type legger til mindre: 0 når ingen base er i noen, 100 når alle baser er der leser ikke kan plasseres entydig.
158
posisjoner i DYRK1A der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helgenomsekvensering dekker alle 159,6 kb av DYRK1A, inkludert introner, ikke bare de 17 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (172)
The DYRK1A variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 120
- Patogen/sannsynligvis patogen 8
- Sannsynligvis patogen 44
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.201_204del (p.Asn68fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.263_264del (p.Ser88fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.322C>T (p.Arg108Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.425dup (p.Asn142fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.449dup (p.Tyr150Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.450C>A (p.Tyr150Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.542_545del (p.Ile181fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.586C>T (p.Arg196Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.658_659del (p.Met220fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.675_676del (p.Cys226fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.736C>T (p.Arg246Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.760C>T (p.Arg254Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.924+1G>C (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.1190_1193del (p.Lys397fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.1282C>T (p.Arg428Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.1372C>T (p.Arg458Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.1378C>T (p.Gln460Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.250_251del (p.Leu84fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.545_548del (p.Lys182fs) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.638-9_638-5del (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome and 1 other | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.638-1G>T (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.664C>T (p.Arg222Ter) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.827A>G (p.His276Arg) (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.924+4_924+7del (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001347721.2(DYRK1A):c.1213-2A>G (opens in a new tab) | DYRK1A-related intellectual disability syndrome | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
See all 172 with every other DYRK1A variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 tilstand
- ADKadenosine kinaseDeler 1 tilstand
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 tilstand
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 tilstand
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 tilstand
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 tilstand
- ANK3ankyrin 3Deler 1 tilstand
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 tilstand
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 tilstand
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 tilstand
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 tilstand
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til DYRK1A
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene DYRK1A kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability, severe
- Severe global developmental delay
- Abnormal gait
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Epilepsy
Vis 35 egenskaper til
- Intellectual disability
- Repetitive movements
- Absent speech development
- Anxiety
- Ataxia
- Autism
- Autism spectrum disorder
- CNS hypomyelination
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Grand mal seizures
- Incoordination
- More active than typical
- Motor delay
- Poor speech
- Small brainstem
- Stereotypical hand wringing
- Thin corpus callosum
- Tongue thrusting
- Ventriculomegaly
- Wide based walk
- Abnormal shape of brainstem
- Aggressive behavior
- Attention deficit
- Difficulty sleeping
- Generalized myoclonic seizure
- Gliosis
- Happy demeanor
- Inappropriate laughter
- Simple febrile seizure
- Sudden loss of muscle tone
- Typical absence seizure
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormality of neuronal migration
- Intellectual disability, mild
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Downturned corners of mouth
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Narrow forehead
- Thin red part of the upper lip
- Abnormal facial shape
- Little lower jaw
- Bulbous nose
Vis 17 egenskaper til
- Development of small head that was not present at birth
- Enlarged cisterna magna
- Full lower lip
- Long face
- Prominent back of the head
- Prominent nasal bridge
- Small head present at birth
- Smooth philtrum
- Widely spaced teeth
- Broad chin
- Broad nasal tip
- Receding chin
- Short nose
- Underdeveloped tissue around nostril
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Cleft soft palate
- Extra teeth
Abnormality of the genitourinary system
- Hydronephrosis
- Abnormality of the genitourinary system
- Absent kidney on one side
- Chordee
- Dilatation of the renal pelvis
- Frequent urinary tract infections
- Hypospadias
- Scrotum surrounds penis
Vis 4 egenskaper til
Abnormality of the digestive system
- Feeding difficulties
- Feeding difficulties in infancy
- Constipation
- Acid reflux
- Inguinal hernia
- Nasogastric tube feeding in infancy
- Poor suck
- Poor swallowing
Vis 3 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-19: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.19-9814e911.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). DYRK1A-genet: dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A. Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/dyrk1a
Dante Labs. DYRK1A-genet: dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A [Internett]. [sitert 20. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/dyrk1a
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker