Genas
NBN
nibrin
- HGNC 7652↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000104320↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 4683↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 8q21.3
- Koordinatės
- Chromosoma 8: 89 933 331–89 984 667 (GRCh38)
- Eksonai
- 16 eksonų per 51,3 kb
- Baltymas
- 754 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- ATV, AT-V2, AT-V1
- Ankstesni simboliai
- NBS, NBS1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000265433.8NM_002485.5
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nbn.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite NBN ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
DNA taisymo sutrikimo liga
- Autosominis recesyvinis
Liga, kurios pagrindas – DNR taisymo mechanizmo sutrikimas.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas NBN
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,6 kb iš 51,3 kb geno; 2 265 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: NBN
1Maža
Kiek sunku sekti NBN trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo NBN egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.3,1 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.3,7 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
415
NBN pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 51,3 kb geno NBN, įskaitant intronus, o ne tik 4,6 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- APTXaprataxinTuri 1 bendrą būklę
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedTuri 1 bendrą būklę
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedTuri 1 bendrą būklę
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Turi 1 bendrą būklę
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Turi 1 bendrą būklę
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CTuri 1 bendrą būklę
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Turi 1 bendrą būklę
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitTuri 1 bendrą būklę
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitTuri 1 bendrą būklę
- ERCC3ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunitTuri 1 bendrą būklę
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitTuri 1 bendrą būklę
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su NBN
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti NBN, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- High palate
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Midface retrusion
- Narrow forehead
- Prominent nose
Rodyti dar 24 savybių
- Receding chin
- Sloping forehead
- Small head present at birth
- Smooth philtrum
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide nasal bridge
- Abnormality of the face
- Beaked nose
- Deep philtrum
- Depressed nasal bridge
- Low frontal hairline
- Prominent nasal bridge
- Short neck
- Small dilated blood vessels near membrane covering front of eye and eyelids
- Abnormality of the eyelid
- Cleft palate
- Eye folds
- Non-midline cleft of the upper lip
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Cleft upper lip
- Long nose
- Malar prominence
- Mastoiditis
- Sinus disease
Abnormality of the nervous system
- Attention deficit
- Delayed speech and language development
- Mental deterioration
- Abnormality of neuronal migration
- Glioma
- Intellectual disability
- Medulloblastoma
- More active than typical
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). NBN genas: nibrin. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/nbn
Dante Labs. NBN genas: nibrin [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/nbn
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites