Gén
MYH3
myosin heavy chain 3
- HGNC 7573↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000109063↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 4621↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 17p13.1
- Koordináták
- 17. kromoszóma: 10 628 532–10 657 309 (GRCh38)
- Exonok
- 41 exon, összesen 28,8 kb
- Fehérje
- 1940 aminosav
- Más néven ismert
- MYHC-EMB, MYHSE1, HEMHC, SMHCE
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000583535.6NM_002470.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/myh3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a MYH3-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) MYH3 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.
A MYH3 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 28,8 kb-jából 6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 5823 bázis kódolja a fehérjét.
MYH3 szekvenálása
4Könnyű
Mennyire nehéz a MYH3 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A MYH3 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ehhez hozzájárul: a MYH3 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.2,6%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.0,3%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.7%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a MYH3 exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
38
a MYH3 azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül 1 (2,6%) olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (1 hely)
A teljes genom a MYH3 mind a 28,8 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 6 kb exont.
ClinVar pathogenic variants (38)
The MYH3 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 14
- Patogén/valószínűleg patogén 1
- Valószínűleg patogén 23
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_002470.4(MYH3):c.2015G>A (p.Arg672His) (opens in a new tab) | Freeman-Sheldon syndrome and 3 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_002470.4(MYH3):c.2014C>T (p.Arg672Cys) (opens in a new tab) | Freeman-Sheldon syndrome and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_002470.4(MYH3):c.1748A>C (p.Tyr583Ser) (opens in a new tab) | Freeman-Sheldon syndrome and 3 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_002470.4(MYH3):c.533C>T (p.Thr178Ile) (opens in a new tab) | Freeman-Sheldon syndrome and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_002470.4(MYH3):c.-9+1G>A (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and spondylocarpotarsal fusion syndrome 1A and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_002470.4(MYH3):c.4647+1G>A (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and spondylocarpotarsal fusion syndrome 1A | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.4111C>T (p.Gln1371Ter) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and spondylocarpotarsal fusion syndrome 1A and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.2501T>C (p.Phe834Ser) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and variable skeletal fusions syndrome 1B | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.2489G>A (p.Trp830Ter) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and variable skeletal fusions syndrome 1B | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.2170C>T (p.Arg724Ter) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and spondylocarpotarsal fusion syndrome 1A | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.1986_1990del (p.Asn662fs) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and spondylocarpotarsal fusion syndrome 1A | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.1581+1G>A (opens in a new tab) | arthrogryposis, distal, type 2B3 and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.1411-391_1411-219del (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and spondylocarpotarsal fusion syndrome 1A | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.748C>T (p.Arg250Ter) (opens in a new tab) | venular insufficiency, systemic | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.141T>G (p.Tyr47Ter) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and spondylocarpotarsal fusion syndrome 1A | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.5772_5773insT (p.Thr1925fs) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and variable skeletal fusions syndrome 1B | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.4179del (p.Lys1393fs) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and variable skeletal fusions syndrome 1B | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.3976-2A>C (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and variable skeletal fusions syndrome 1B | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.3247_3248+1del (opens in a new tab) | Freeman-Sheldon syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.3102+2T>G (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and variable skeletal fusions syndrome 1B | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.3007dup (p.Ala1003fs) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and variable skeletal fusions syndrome 1B | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.2682+1G>A (opens in a new tab) | Freeman-Sheldon syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.2512A>C (p.Lys838Gln) (opens in a new tab) | distal arthrogryposis | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.2419C>T (p.Gln807Ter) (opens in a new tab) | contractures, pterygia, and variable skeletal fusions syndrome 1B | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_002470.4(MYH3):c.2306G>C (p.Gly769Ala) (opens in a new tab) | Freeman-Sheldon syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
See all 38 with every other MYH3 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
A(z) MYH3 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) MYH3 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of head or neck
- Dental crowding
- Depressed nasal bridge
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Flat face
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Narrow mouth
- Pursed lips
Még 36 tulajdonság megjelenítése
- Short neck
- Short nose
- Wide nasal bridge
- Abnormal dentition
- Dimple chin
- Flat nose
- Restricted neck mobility due to contractures
- Underdeveloped tissue around nostril
- Webbed neck
- Abnormality of the eyelid
- Abnormally small head
- Cleft nostril
- Cleft of the mouth
- Corners of eye widely separated
- Eye folds
- Facial asymmetry
- High palate
- Long face
- Long nasal bridge
- Narrow face
- Pointed chin
- Thin dental enamel
- Abnormality of the tongue
- Cleft palate
- Deformity of the skull
- Frontal bossing
- Long, narrow head
- Low hairline at back of neck
- Big lower jaw
- Chin with H-shaped crease
- Expressionless face
- Narrow opening between the eyelids
- Prominent forehead
- Triangular face
- Whistling appearance
- Zygomatic flattening
Abnormality of limbs
- Club feet
- Flexion contracture of finger
- Inward turned thumb
- Overlapping toe
- Rocker bottom foot
- Ulnar deviation of the hand
- Aplasia/Hypoplasia of the radius
- Bilateral single transverse palmar creases
Még 24 tulajdonság megjelenítése
- Finger bends toward pinky
- Finger syndactyly
- Fused finger bones
- Overlapping fingers
- Permanent flexion of the finger
- Wrist flexion contracture
- Abnormal feet structure
- Absent phalangeal crease
- Elbow flexion contracture
- Fused ankle bones
- Fused wrist bones
- Hip contracture
- Inability to straighten knee
- Talipes
- Ulnar deviation of the wrist
- Absent palm lines
- Delayed maturation of wrist bone
- Dropped arches
- Webbed fingers
- Bunion
- Flexion contracture of toe
- Hip dislocation
- Joint contracture of the hand
- Ulnar deviation of the hand or of fingers of the hand
Abnormality of the musculoskeletal system
- Flexed joint that cannot be straightened
- Fused thoracic vertebrae
- Permanent flexion of the finger or toe
- Scoliosis
- Abnormality of the sternum
- Funnel chest
- Joint stiffness
- Limitation of joint mobility
Még 23 tulajdonság megjelenítése
- Abnormality of the hip bone
- Abnormally shaped skeletal
- Arthrogryposis multiplex congenita
- Elbow contracture
- Excessive inward curvature of lower spine
- Fused neck
- Intervertebral space narrowing
- Pigeon chest
- Vertebral fusion
- Vertebral segmentation defect
- Cervical spinal canal stenosis
- Delayed bone maturation
- Displacement of one backbone compared to another
- Hernia
- Joint dislocation
- Muscle degeneration
- Recurrent fractures
- Rib fusion
- Barrel-shaped chest
- Kyphoscoliosis
- Missing part of vertebrae
- Muscle weakness
- Shoulder flexion contracture
Abnormality of the nervous system
- Motor delay
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Abnormal gait
- Cognitive impairment
- Spina bifida occulta
- Abnormal auditory evoked potentials
- Degeneration of cerebellum
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). MYH3 gén: myosin heavy chain 3. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/myh3
Dante Labs. MYH3 gén: myosin heavy chain 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/myh3
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt