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Gène

CANT1

calcium activated nucleotidase 1

Résumé

Localisation cytogénétique
17q25.3
Coordonnées
Chromosome 17 : 78 991 716–79 009 764 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 18 kb
Protéine
401 acides aminés
Aussi appelé
SHAPY, SCAN-1
Transcrit MANE Select
ENST00000392446.10NM_001159773.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CANT1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CANT1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de CANT1. CANT1 et 9 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 78 500 740 à 79 500 739.Chromosome 1717q25.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.378,6 Mb78,8 Mb79 Mb79,2 Mb79,4 MbDNAH17 : 78 423 697–78 577 396, brin inverseDNAH17CYTH1 : 78 674 048–78 782 329, brin inverseCYTH1USP36 : 78 787 381–78 841 441, brin inverseUSP36TIMP2 : 78 852 977–78 925 396, brin inverseTIMP2CEP295NL : 78 890 579–78 903 217, brin inverseCEP295NLLGALS3BP : 78 970 308–78 979 969, brin inverseLGALS3BPCANT1 : 78 991 716–79 009 764, brin inverseCANT1C1QTNF1 : 79 022 729–79 049 788, brin directC1QTNF1ENGASE : 79 074 770–79 091 967, brin directENGASERBFOX3 : 79 089 345–79 611 317, brin inverseRBFOX3Schéma de CANT1 : 5 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 5 : 6 sites connus associés à une maladieExon 4 : 6 sites connus associés à une maladieExon 3 : 8 sites connus associés à une maladieExon 5 : 78 991 716–78 993 920, 2 205 basesExon 4 : 78 995 018–78 995 221, 204 basesExon 3 : 78 996 992–78 997 644, 653 basesExon 2 : 78 997 840–78 997 963, 124 basesExon 1 : 79 009 664–79 009 764, 101 bases543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,3 kb sur les 18 kb du gène ; 1 206 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit CANT1

21

positions dans CANT1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 18 kb de CANT1, introns compris, et pas seulement les 3,3 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CANT1 : calcium activated nucleotidase 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/cant1

Vancouver

Dante Labs. Gène CANT1 : calcium activated nucleotidase 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/cant1

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