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Gène

RBFOX3

RNA binding fox-1 homolog 3

Résumé

Localisation cytogénétique
17q25.3
Coordonnées
Chromosome 17 : 79 089 345–79 611 051 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 521,7 kb
Protéine
359 acides aminés
Aussi appelé
FOX-3, NeuN, HRNBP3
Transcrit MANE Select
ENST00000693108.1NM_001350451.2
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RBFOX3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RBFOX3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de RBFOX3. RBFOX3 et 17 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 78 567 638 à 80 132 758.Chromosome 1717q25.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.378,6 Mb78,8 Mb79 Mb79,2 Mb79,4 Mb79,6 Mb79,8 Mb80 MbDNAH17 : 78 423 697–78 577 396, brin inverseDNAH17CYTH1 : 78 674 048–78 782 329, brin inverseCYTH1USP36 : 78 787 381–78 841 441, brin inverseUSP36TIMP2 : 78 852 977–78 925 396, brin inverseTIMP2CEP295NL : 78 890 579–78 903 217, brin inverseCEP295NLLGALS3BP : 78 970 308–78 979 969, brin inverseLGALS3BPCANT1 : 78 991 707–79 009 867, brin inverseCANT1C1QTNF1 : 79 022 729–79 049 788, brin directC1QTNF1ENGASE : 79 074 770–79 091 967, brin directENGASERBFOX3 : 79 089 345–79 611 051, brin inverseRBFOX3ENPP7 : 79 728 809–79 742 930, brin directENPP7CBX2 : 79 778 135–79 788 394, brin directCBX2CBX8 : 79 792 132–79 801 683, brin inverseCBX8CBX4 : 79 833 156–79 839 486, brin inverseCBX4TBC1D16 : 79 932 343–80 035 887, brin inverseTBC1D16CCDC40 : 80 036 000–80 100 613, brin directCCDC40GAA : 80 101 526–80 119 881, brin directGAAEIF4A3 : 80 132 700–80 147 151, brin inverseEIF4A3Schéma de RBFOX3 : 15 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 15 : 79 089 345–79 090 885, 1 541 basesExon 14 : 79 094 451–79 094 529, 79 basesExon 13 : 79 095 513–79 095 574, 62 basesExon 12 : 79 096 653–79 096 833, 181 basesExon 11 : 79 097 292–79 097 424, 133 basesExon 10 : 79 097 692–79 097 745, 54 basesExon 9 : 79 101 584–79 101 644, 61 basesExon 8 : 79 103 162–79 103 254, 93 basesExon 7 : 79 104 073–79 104 126, 54 basesExon 6 : 79 106 651–79 106 788, 138 basesExon 5 : 79 115 494–79 115 748, 255 basesExon 4 : 79 235 766–79 235 805, 40 basesExon 3 : 79 307 724–79 307 824, 101 basesExon 2 : 79 482 454–79 482 598, 145 basesExon 1 : 79 610 826–79 611 051, 226 bases1515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,2 kb sur les 521,7 kb du gène ; 1 080 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de RBFOX3

8Facile

Difficulté de séquençage de RBFOX3 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de RBFOX3 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de RBFOX3 dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions4,9 %
  • Teneur en GC68 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RBFOX3 : RNA binding fox-1 homolog 3. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rbfox3

Vancouver

Dante Labs. Gène RBFOX3 : RNA binding fox-1 homolog 3 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rbfox3

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