Geen
TRAPPC11
trafficking protein particle complex subunit 11
- HGNC 25751↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000168538↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 60684↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 4q35.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 4: 183 659 293–183 713 589 (GRCh38)
- Eksonid
- 30 eksonit, ulatus 54,3 kb
- Valk
- 1133 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FLJ12716, gry, foigr
- Varasemad tähised
- C4orf41
- MANE Select transkript
- ENST00000334690.11NM_021942.6
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe TRAPPC11 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Vöölihaste lihasdüstroofia
Vöölihaste lihasdüstroofia on mitme alatüübi kogum, mille pärilikkuse mustrid on erinevad (ka diagnoosi kindlaksmääramise piisavus on erinev). Selle haigusega seotud variantide kandjad peaksid kindla diagnoosi saamiseks pöörduma lihas-skeleti haiguste spetsialisti poole.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas TRAPPC11 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,5 kb kogupikkusega 54,3 kb; neist 3402 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse TRAPPC11
61
kohad geenis TRAPPC11, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni TRAPPC11 54,3 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,5 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ANO5anoctamin 5Jagab 1 haigust
- CAPN3calpain 3Jagab 1 haigust
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainJagab 1 haigust
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainJagab 1 haigust
- DAG1dystroglycan 1Jagab 1 haigust
- DNAJB6DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6Jagab 1 haigust
- DYSFdysferlinJagab 1 haigust
- FKRPfukutin related proteinJagab 1 haigust
- FKTNfukutinJagab 1 haigust
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BJagab 1 haigust
- HMGCR3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductaseJagab 1 haigust
Geeniga TRAPPC11 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida TRAPPC11 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Absent speech development
- Cerebral white matter atrophy
- Chorea
- Decreased reflex response
- Degeneration of cerebrum
- Global developmental delay
- Hyperactive movements
Näita veel 20 tunnust
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Intellectual disability
- Intellectual disability, borderline
- Waddling gait
- Ataxia
- CNS hypomyelination
- Degeneration of cerebellum
- Epilepsy
- Grand mal seizures
- Increased reflexes
- Loss of developmental milestones
- Motor axonal neuropathy
- EEG abnormality
- Difficulty articulating speech
- Dystonia
- Inability to walk
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Poor speech
- Speech apraxia
- Tremor
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). TRAPPC11 geen: trafficking protein particle complex subunit 11. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/trappc11
Dante Labs. TRAPPC11 geen: trafficking protein particle complex subunit 11 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/trappc11
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast