Geen
PIGV
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V
- HGNC 26031↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000060642↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 55650↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1p36.11
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 26 787 950–26 800 659 (GRCh38)
- Eksonid
- 4 eksonit, ulatus 12,7 kb
- Valk
- 493 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- FLJ20477, PIG-V, GPI-MT-II
- MANE Select transkript
- ENST00000674202.1NM_017837.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PIGV ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
GPI-ankurdumise biosünteesi defektid
- PIGV-ga seotud hüperfosfatasia koos intellektuaalse arengu häirega (HPMRS1)Autosoomne retsessiivne
Mabry sündroomi kõige sagedamini kirjeldatud vorm, mida põhjustavad PIGV variandid.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: mõõdukas
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Hüperfosfatasia koos intellektuaalse arengu häirega (Mabry sündroom)Autosoomne retsessiivne
GPI-ankru defektide rühm (PIGV, PIGO, PGAP2, PGAP3, PIGW, PIGY), mille korral püsivalt kõrge leeliseline fosfataas kaasneb arengu viivitusega, krampide ja sõrmede lühikeste pikkade luudega.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: mõõdukas
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Mõnel mõjutatud lapsel on krampide kontrolli parandanud püridoksiin (B6-vitamiin), seega võib diagnoos juhatada spetsialisti katseraviks.
- GPI-ankurdumise biosünteesi häired
Pärilike seisundite rühm, mida põhjustavad GPI ankru moodustamiseks ja kinnitamiseks vajalike geenide PIG, PGAP ja nendega seotud geenide variandid. Tavaliselt kaasnevad arengu viivitus, madal lihastoonus ja epilepsia.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: mõõdukas
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Glükosüleerimise kaasasündinud häired
- Glükosüleerimise kaasasündinud häired (CDG)
Üks 98 sellega seotud geenist
Suur rühm pärilikke haigusi, mille puhul suhkruahelad (glükaanid) ei moodustu ega kinnitu valkudele ja lipiididele õigesti; need mõjutavad sageli aju, maksa, vere hüübimist, kasvu ja paljusid teisi elundisüsteeme. Enamik neist on autosomaalselt retsessiivse pärilikkusega, kuid osa on X-seotud või autosomaalselt dominantse pärilikkusega.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: mõõdukas
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas PIGV on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,7 kb kogupikkusega 12,7 kb; neist 1482 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PIGV
6
kohad geenis PIGV, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PIGV 12,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,7 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- PGAP2post-GPI attachment to proteins 2Jagab 3 haigust
- PGAP3post-GPI attachment to proteins phospholipase 3Jagab 3 haigust
- PIGOphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class OJagab 3 haigust
- PIGWphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class WJagab 3 haigust
- PIGYphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class YJagab 3 haigust
- PIGAphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class AJagab 2 haigust
- PIGGphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G (EMM blood group)Jagab 2 haigust
- PIGLphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class LJagab 2 haigust
- PIGNphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class NJagab 2 haigust
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class TJagab 2 haigust
- ST3GAL5ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5Jagab 2 haigust
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Jagab 1 haigust
Geeniga PIGV seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PIGV võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of head or neck
- Broad nasal tip
- Downturned corners of mouth
- Wide nasal bridge
- Abnormal facial shape
- Broad opening between the eyelids
- Tented mouth
- Thin red part of the upper lip
- Upward slanting of the opening between the eyelids
Näita veel 23 tunnust
- Abnormal parietal bone morphology
- Asymmetry of the posterior head
- Bifid uvula
- Big lower jaw
- Broad head shape
- Broad philtrum
- Bulbous nose
- Cleft palate
- Cleft upper lip
- Coarse facial features
- Decreased head circumference
- Eye folds
- High palate
- Highly arched eyebrow
- Increased head circumference
- Little lower jaw
- Prominent nasal bridge
- Round face
- Short neck
- Short philtrum
- Midface retrusion
- Short nose
- Zygomatic flattening
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Epilepsy
- Grand mal seizures
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Abnormal gait
- Ataxia
Näita veel 12 tunnust
- Autism spectrum disorder
- Cerebral hypomyelination
- Delayed speech and language development
- Diminished deep tendon reflex
- EEG with polyspike wave complexes
- EEG with spike-wave complexes
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
- Jerking
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed myelination
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PIGV geen: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pigv
Dante Labs. PIGV geen: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pigv
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast