Geen
GP1BA
glycoprotein Ib platelet subunit alpha
- HGNC 4439↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000185245↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 2811↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 17p13.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 17: 4 932 277–4 935 023 (GRCh38)
- Eksonid
- 2 eksonit, ulatus 2,7 kb
- Valk
- 652 aminohapet
- Tuntud ka kui
- HPA-2, CD42b, GPIbalpha
- Varasemad tähised
- GP1B
- MANE Select transkript
- ENST00000329125.6NM_000173.7
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gp1ba.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe GP1BA ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Pärilik von Willebrandi tõbi
Pärilik von Willebrandi tõbi (VWD) on pärilik verejooksuhäire, mis on põhjustatud geneetilisest kõrvalekaldest, mis viib Willebrandi faktori (von Willebrandi faktor; VWF) kvantitatiivsete, struktuursete või funktsionaalsete häireteni. On määratletud kaks peamist VWF-puudulikkuse rühma: kvantitatiivne ja osaline (1. tüüp) või täielik (3. tüüp), ning kvalitatiivne (2. tüüp), millel on mitu alatüüpi (2A, 2B, 2M, 2N).
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
1. tüüp: desmopressiin (DDAVP); 2A tüüp: DDAVP-katse või VWF-kontsentraat; 2B tüüp: VWF-kontsentraat (DDAVP on vastunäidustatud); 2M tüüp: DDAVP-katse; 2N tüüp: VWF/FVIII-kontsentraat; 3. tüüp: VWF/FVIII-kontsentraat; limaskestaverejooksu korral traneksaamhape
Ärilised trombotsüütide funktsioonihäired
- Bernard-Soulier’ sündroomAutosoomne retsessiivne
Haigus, mida põhjustavad muutused geenides GP1BA, GP1BB või GP9. Trombotsüüdid on suured, nende arv on vähenenud ning nad ei suuda kahjustunud veresoontele kinnituda. Tavaliselt on tegemist retsessiivse pärandiga, kuigi esineb ka kergemaid dominantseid vorme.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 4 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Õige diagnoos väldib olukorda, kus seda eksitatakse immuunsest trombotsütopeeniast ja ravitakse põhjendamatult.
Kuidas GP1BA on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,5 kb kogupikkusega 2,7 kb; neist 1959 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: GP1BA
68
GP1BA positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu GP1BA geeni 2,7 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 2,5 kb eksoneid.
Variandid, millel on leht (44)
Siin on GP1BA variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A318Pfs*17 | c.952del | Ekson 2 | 4 933 555 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| c.1077del | Ekson 2 | 4 933 679 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| C81R | c.241T>C | Ekson 2 | 4 932 845 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| C225R | c.673T>C | Ekson 2 | 4 933 277 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| C225S | c.673T>A | Ekson 2 | 4 933 277 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D79Efs*2 | c.236dup | Ekson 2 | 4 932 839 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D89Efs*63 | c.266dup | Ekson 2 | 4 932 869 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| E347X | c.1039G>T | Ekson 2 | 4 933 643 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| E489Nfs*64 | c.1465del | Ekson 2 | 4 934 068 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| F208Lfs*48 | c.624del | Ekson 2 | 4 933 222 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
Geeniga GP1BA seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida GP1BA võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally heavy bleeding during menstruation
- Impaired ristocetin-induced platelet aggregation
- Large platelets
- Low platelet count
- Macrothrombocytopenia
- Neonatal alloimmune thrombocytopenia
- Prolonged bleeding after dental extraction
- Bleeding tendency
Näita veel 23 tunnust
- Decreased platelet glycoprotein Ib-IX-V
- Giant platelets
- Blood spots
- Bloody nose
- Cephalohematoma
- Gastrointestinal bleeding
- Petechiae
- Platelet anisocytosis
- Recurring nosebleed
- Spontaneous hematomas
- Abnormal megakaryocyte morphology
- Black feces
- Bleeding gums
- Bleeding within the skull
- Bruising susceptibility
- Ecchymosis
- Prolonged bleeding after surgery
- Vomiting blood
- Subarachnoid hemorrhage
- Hemolytic anemia
- Intermittent thrombocytopenia
- Prolonged bleeding time
- Stomatocytosis
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). GP1BA geen: glycoprotein Ib platelet subunit alpha. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/gp1ba
Dante Labs. GP1BA geen: glycoprotein Ib platelet subunit alpha [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/gp1ba
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast