Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SPNS2

SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
17p13.2
Koordinaadid
Kromosoom 17: 4 498 881–4 539 035 (GRCh38)
Eksonid
13 eksonit, ulatus 40,2 kb
Valk
549 aminohapet
Tuntud ka kui
SLC63A2
MANE Select transkript
ENST00000329078.8NM_001124758.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SPNS2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SPNS2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 17, millel on sulg kohal, kus asub SPNS2. SPNS2 ja sellele lähedal asuvad 32 geeni kromosoomil 17, vahemikus 4 018 958 kuni 5 018 957.Kromosoom 1717p13.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.34,2 Mb4,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 MbZZEF1: 4 004 432–4 143 628, pöördne ahelZZEF1CYB5D2: 4 143 168–4 188 683, otsene ahelCYB5D2ANKFY1: 4 163 821–4 263 995, pöördne ahelANKFY1UBE2G1: 4 269 221–4 366 678, pöördne ahelUBE2G1SPNS3: 4 433 940–4 488 208, otsene ahelSPNS3SPNS2: 4 498 881–4 539 035, otsene ahelSPNS2MYBBP1A: 4 538 897–4 555 403, pöördne ahelMYBBP1AGGT6: 4 556 342–4 560 818, pöördne ahelGGT6SMTNL2: 4 583 999–4 608 798, otsene ahelSMTNL2ALOX15: 4 629 736–4 642 294, pöördne ahelALOX15PELP1: 4 669 774–4 704 337, pöördne ahelPELP1ARRB2: 4 710 393–4 721 500, otsene ahelARRB2MED11: 4 731 411–4 733 610, otsene ahelMED11CXCL16: 4 732 915–4 740 064, pöördne ahelCXCL16ZMYND15: 4 739 108–4 746 119, otsene ahelTM4SF5: 4 771 835–4 783 220, otsene ahelTM4SF5VMO1: 4 785 281–4 790 406, pöördne ahelVMO1GLTPD2: 4 788 927–4 790 734, otsene ahelGLTPD2PSMB6: 4 796 144–4 798 503, otsene ahelPSMB6C17orf114: 4 801 159–4 807 013, pöördne ahelPLD2: 4 807 074–4 823 434, otsene ahelMINK1: 4 833 147–4 898 065, otsene ahelMINK1CHRNE: 4 897 769–4 934 438, pöördne ahelCHRNEC17orf107: 4 899 418–4 902 934, otsene ahelC17orf107GP1BA: 4 932 261–4 935 023, otsene ahelGP1BASLC25A11: 4 934 570–4 940 156, pöördne ahelSLC25A11RNF167: 4 939 997–4 945 223, otsene ahelPFN1: 4 945 652–4 950 517, pöördne ahelENO3: 4 948 034–4 957 132, otsene ahelSPAG7: 4 959 226–4 967 835, pöördne ahelCAMTA2: 4 967 992–4 987 684, pöördne ahelINCA1: 4 988 130–4 999 117, pöördne ahelINCA1KIF1C: 4 997 629–5 028 401, otsene ahelKIF1CSPNS2 skeem: 13 eksonit kromosoomi 17 otsene ahelalEkson 1: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 4 498 881–4 499 417, 537 alustEkson 2: 4 513 247–4 513 312, 66 alustEkson 3: 4 525 057–4 525 193, 137 alustEkson 4: 4 530 632–4 530 783, 152 alustEkson 5: 4 531 053–4 531 119, 67 alustEkson 6: 4 532 542–4 532 684, 143 alustEkson 7: 4 532 977–4 533 129, 153 alustEkson 8: 4 533 243–4 533 432, 190 alustEkson 9: 4 533 788–4 533 853, 66 alustEkson 10: 4 536 076–4 536 174, 99 alustEkson 11: 4 536 263–4 536 426, 164 alustEkson 12: 4 536 900–4 536 946, 47 alustEkson 13: 4 537 453–4 539 035, 1583 alust1510135′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,4 kb kogupikkusega 40,2 kb; neist 1650 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse SPNS2

1

koht geenis SPNS2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SPNS2 40,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,4 kb).

Geeniga SPNS2 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SPNS2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SPNS2 geen: SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/spns2

Vancouver

Dante Labs. SPNS2 geen: SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/spns2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test