Geen
CLCN7
Cl-/H+ antiporter 7
- HGNC 2025↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000103249↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1186↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 16p13.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 16: 1 444 935–1 475 028 (GRCh38)
- Eksonid
- 25 eksonit, ulatus 30,1 kb
- Valk
- 805 aminohapet
- Tuntud ka kui
- CLC-7, OPTA2, CLC7, ClC-7, PPP1R63
- MANE Select transkript
- ENST00000382745.9NM_001287.6
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe CLCN7 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Osteopetroos
Osteopetroos ehk marmorluuhaigus on kirjeldav mõiste, mis viitab haruldaste, pärilike luustikuhaiguste rühmale, mida iseloomustab röntgenpildil suurenenud luutihedus.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas CLCN7 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,2 kb kogupikkusega 30,1 kb; neist 2418 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CLCN7
41
kohad geenis CLCN7, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 1 (2,4%) asub lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Low mappability (1 koht)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CLCN7 30,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,2 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- AMER1APC membrane recruitment protein 1Jagab 1 haigust
- CA2carbonic anhydrase 2Jagab 1 haigust
- CTSKcathepsin KJagab 1 haigust
- FERMT3FERM domain containing kindlin 3Jagab 1 haigust
- LRP5LDL receptor related protein 5Jagab 1 haigust
- LRRK1leucine rich repeat kinase 1Jagab 1 haigust
- OSTM1osteoclastogenesis associated transmembrane protein 1Jagab 1 haigust
- PLEKHM1pleckstrin homology and RUN domain containing M1Jagab 1 haigust
- RASGRP2RAS guanyl releasing protein 2Jagab 1 haigust
- SNX10sorting nexin 10Jagab 1 haigust
- TCIRG1T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3Jagab 1 haigust
- TNFRSF11ATNF receptor superfamily member 11aJagab 1 haigust
Geeniga CLCN7 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CLCN7 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Harder, denser, fracture-prone bones
- Increased bone mineral density
- Abnormal shape of end part of bone
- Abnormality of bone mineral density
- Abnormality of the ribs
- Arthritis
- Bone pain
- Death of bone due to decreased blood supply
Näita veel 17 tunnust
- Degenerative joint disease
- Increased bone density in skeletal bones
- Joint dislocation
- Low solidness and mass of the bones
- Narrow chest
- Recurrent fractures
- Back pain
- Cortical sclerosis
- Generalized decreased muscle tone
- Increased susceptibility to fractures
- Sandwich appearance of vertebral bodies
- Scoliosis
- Abnormal shape of pelvic girdle bone
- Abnormality of the vertebral endplates
- Hip osteoarthritis
- Recurrent long bone fractures
- Sclerotic vertebral endplates
Abnormality of the eye
- Abnormality of visual evoked potentials
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Opsoclonus
- Optic disc pallor
- Optic nerve compression
- Visual impairment
- Decreased clarity of vision
- Optic atrophy
Näita veel 4 tunnust
Abnormality of the nervous system
- Degeneration of cerebellum
- Delayed CNS myelination
- Delayed fine motor development
- Delayed motor skills
- Abnormality of movement
- Cranial nerve paralysis
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Tremor
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CLCN7 geen: Cl-/H+ antiporter 7. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/clcn7
Dante Labs. CLCN7 geen: Cl-/H+ antiporter 7 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/clcn7
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast