Gen
RPL11
ribosomal protein L11
- HGNC 10301↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000142676↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6135↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 1p36.11
- Koordinater
- Kromosom 1: 23 691 806–23 696 835 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner på 5 kb
- Protein
- 178 aminosyror, 20,3 kDa
- Även känd som
- L11, uL5
- MANE Select-transkript
- ENST00000643754.2NM_000975.5
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Share this page
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rpl11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs RPL11, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Diamant-Blackfans anemi
- Autosomalt dominant
En medfödd aregenerativ och ofta makrocytär anemi med erytroblastopeni.
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är RPL11 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1 kb av genens 5 kb, och 537 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av RPL11
0Lätt
Hur svår RPL11 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i RPL11 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som tillkommer: andelen av RPL11s exoner i varje typ av svår region
- KartläggbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 100.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- Delas med chrYDe pseudoautosomala regionerna och den X-transponerade regionen, där chrX och chrY bär samma eller nästan samma sekvens, så en läsning från den ena kan placeras på den andra. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassemblyn, där det inte finns någon sekvens för läsningarna att anpassas mot. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 50.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, där läsningar glider och som kanske inte spänns över. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 30.0 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker glest. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 20.0 %
Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts detVarje stapel är andelen av RPL11s exonbaser i den typen av svår region. Varje enskild typ kan göra en gen svår på egen hand, och varje ytterligare typ lägger till mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
39
positioner i RPL11 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsprov täcker alla 5 kb av RPL11, inklusive introner, och inte bara de 1 kb exoner.
ClinVar-patogena varianter (42)
De RPL11-varianter som ClinVar klassificerar som patogena eller sannolikt patogena för något tillstånd, granskade av minst en inlämnare med angivna kriterier, samt de mest granskade av dem. Det är ClinVars offentliga register över genen, aldrig ett resultat.
- Patogen 30
- Sannolikt patogen 12
| Variant | Tillstånd | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000975.5(RPL11):c.6+2T>C | Diamond-Blackfan anemia och 1 till | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_000975.5(RPL11):c.60_61del (p.Cys21fs) | Diamond-Blackfan anemia och 1 till | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_000975.5(RPL11):c.94_97del (p.Asp31_Arg32insTer) | Diamond-Blackfan anemia 7 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_000975.5(RPL11):c.223C>T (p.Arg75Ter) | Diamond-Blackfan anemia och 1 till | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_000975.5(RPL11):c.465_466del (p.His155fs) | Diamond-Blackfan anemia och 1 till | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_000975.5(RPL11):c.18_25del (p.Lys8fs) | Diamond-Blackfan anemia och 1 till | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.33del (p.Met12fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.43_49del (p.Leu15fs) | Diamond-Blackfan anemia 7 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.62_63del (p.Cys21fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.96_109del (p.Arg32fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.95_96del (p.Arg32fs) | Diamond-Blackfan anemia 7 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.100dup (p.Thr34fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.102dup (p.Arg35fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.107del (p.Ala36fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.111del (p.Lys38fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.121G>T (p.Glu41Ter) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.124C>T (p.Gln42Ter) | Diamond-Blackfan anemia 7 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.136C>T (p.Gln46Ter) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.143_144del (p.Pro48fs) | Diamond-Blackfan anemia 7 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.151dup (p.Ser51fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.158-2A>C | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.158-1G>A | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.158-1G>C | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.160dup (p.Arg54fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000975.5(RPL11):c.290dup (p.Asn97fs) | Diamond-Blackfan anemia | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Visa alla 42 tillsammans med alla andra RPL11-varianter i ClinVar → (öppnas i en ny flik)
Gener kopplade till samma tillstånd
- GATA1GATA binding protein 1Delar 1 tillstånd
- HEATR3HEAT repeat containing 3Delar 1 tillstånd
- RPL15ribosomal protein L15Delar 1 tillstånd
- RPL26ribosomal protein L26Delar 1 tillstånd
- RPL35Aribosomal protein L35aDelar 1 tillstånd
- RPL5ribosomal protein L5Delar 1 tillstånd
- RPS10ribosomal protein S10Delar 1 tillstånd
- RPS17ribosomal protein S17Delar 1 tillstånd
- RPS19ribosomal protein S19Delar 1 tillstånd
- RPS24ribosomal protein S24Delar 1 tillstånd
- RPS26ribosomal protein S26Delar 1 tillstånd
- RPS29ribosomal protein S29Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till RPL11
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som RPL11 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-21: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.21-311f020e.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). RPL11-genen: ribosomal protein L11. Hämtad 21 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/rpl11
Dante Labs. RPL11-genen: ribosomal protein L11 [Internet]. [citerad 21 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/rpl11
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor