Gen
LIG3
DNA ligase 3
- HGNC 6600↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000005156↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 3980↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 17q12
- Koordinatlar
- Kromozom 17: 34.980.512–35.009.743 (GRCh38)
- Eksonlar
- 29,2 kb boyunca 20 ekson
- Protein
- 1.009 amino asit
- Diğer adları
- LIG3alpha
- Önceki semboller
- LIG2
- MANE Select transkripti
- ENST00000378526.9NM_013975.4
- Lokus türü
- gene with protein product
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Referans genomGRCh38hg38
Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.
LIG3 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Primer Mitokondriyal Hastalık
- Mitokondriyal DNA Azalma Sendromu
POLG, TWNK, TK2, DGUOK, MPV17, RRM2B ve SUCLA2 gibi nükleer genlerdeki varyantlardan kaynaklanır. Bu varyantlar mitokondriyal DNA miktarını azaltır ve kas, karaciğer ya da beyin hastalığına yol açabilir.
- 2 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Bilmenin neleri değiştirdiği
Bu bilgi doğrudan eyleme dönüştürülebilir: POLG hastalığında ölümcül karaciğer yetmezliği riski nedeniyle valproattan kaçınılmalıdır. TK2 eksikliğinin ise nükleozid tedavisi bulunmaktadır.
LIG3 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 29,2 kb uzunluğunun 8,4 kb'sini oluşturur; bu bazların 3.030 tanesi proteini kodlar.
Bir genom testi LIG3 genini nasıl okur
6
LIG3 içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom, LIG3 genindeki 29,2 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 8,4 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 21 durumu paylaşıyor
- AGKacylglycerol kinase1 durumu paylaşıyor
- DGUOKdeoxyguanosine kinase1 durumu paylaşıyor
- DNA2DNA replication helicase/nuclease 21 durumu paylaşıyor
- FBXL4F-box and leucine rich repeat protein 41 durumu paylaşıyor
- GUK1guanylate kinase 11 durumu paylaşıyor
- MGME1mitochondrial genome maintenance exonuclease 11 durumu paylaşıyor
- MPV17mitochondrial inner membrane protein MPV171 durumu paylaşıyor
- MRM2mitochondrial rRNA methyltransferase 21 durumu paylaşıyor
- OPA1OPA1 mitochondrial dynamin like GTPase1 durumu paylaşıyor
- POLGDNA polymerase gamma, catalytic subunit1 durumu paylaşıyor
- RRM2Bribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B1 durumu paylaşıyor
LIG3 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, LIG3 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Headache
- Diffuse leukoencephalopathy
- Leukoencephalopathy
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal pyramidal sign
- Decreased motor nerve conduction velocity
- Decreased number of large peripheral myelinated nerve fibers
13 özellik daha göster
- Decreased sensory nerve conduction velocity
- Degeneration of cerebellum
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Pins and needles feeling
- Intellectual disability
- Involuntary movements
- Jerking
- Lack of coordination of movement
- Mental deterioration
- Thin corpus callosum
- Dementia
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-16 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). LIG3 geni: DNA ligase 3. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lig3
Dante Labs. LIG3 geni: DNA ligase 3 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lig3
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde