Gen
XYLT2
xylosyltransferase 2
- HGNC 15517↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000015532↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 64132↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 17q21.33
- Koordinater
- Kromosom 17: 50 346 126–50 361 185 (GRCh38)
- Exoner
- 11 exoner på 15,1 kb
- Protein
- 865 aminosyror
- Även känd som
- XT-II, PXYLT2
- MANE Select-transkript
- ENST00000017003.7NM_022167.4
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/xylt2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs XYLT2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Osteogenesis imperfecta
En grupp ärftliga bindvävssjukdomar som orsakar sköra ben som lätt bryts, ofta med blå sklera, hörselnedsättning och tandproblem.
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Cykliska intravenösa bisfosfonater (pamidronat, zoledronat); ortopedisk märgspikning av långa ben; fysioterapi; denosumab (används kliniskt vid OI hos barn); romosozumab (under utveckling); hörselkontroller; tandvård vid dentinogenesis imperfecta
Vitreoretinopati
- Spondylo-okulärt syndromAutosomalt recessiv
Spondylo-okulärt syndrom är en mycket sällsynt kombination av symtom från ryggrad och ögon, som kännetecknas av täta katarakter och näthinneavlossning samt generaliserad osteoporos och platyspondyli. Lindrig kraniofacial dysmorfism har rapporterats, inklusive kort hals, stort huvud och framträdande ögonbryn.
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är XYLT2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,5 kb av genens 15,1 kb, och 2 598 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av XYLT2
4
positioner i XYLT2 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 15,1 kb av XYLT2, inklusive introner, och inte bara de 3,5 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ANO5anoctamin 5Delar 1 tillstånd
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Delar 1 tillstånd
- BMP1bone morphogenetic protein 1Delar 1 tillstånd
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainDelar 1 tillstånd
- COL1A2collagen type I alpha 2 chainDelar 1 tillstånd
- CREB3L1cAMP responsive element binding protein 3 like 1Delar 1 tillstånd
- CRTAPcartilage associated proteinDelar 1 tillstånd
- FKBP10FKBP prolyl isomerase 10Delar 1 tillstånd
- GORABgolgin, RAB6 interactingDelar 1 tillstånd
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Delar 1 tillstånd
- IFITM5interferon induced transmembrane protein 5Delar 1 tillstånd
- KDELR2KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till XYLT2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som XYLT2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Compression fracture of a vertebral body
- Flattened vertebrae
- Abnormal intervertebral disk morphology
- Disproportionate short-trunked short stature
- Osteoporosis
- Thoracic kyphosis
- Muscle weakness
- Pigeon chest
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of head or neck
- Abnormality of the eyebrow
- Short neck
- Decreased facial muscle tone
- Low hairline at back of neck
- Webbed neck
- Decreased volume of lip
- Long philtrum
- Pit in front of the ear
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). XYLT2-genen: xylosyltransferase 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/xylt2
Dante Labs. XYLT2-genen: xylosyltransferase 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/xylt2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor