Gen
SLC2A10
solute carrier family 2 member 10
- HGNC 13444↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000197496↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 81031↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 20q13.12
- Koordinater
- Kromosom 20: 46 709 649–46 736 347 (GRCh38)
- Exoner
- 5 exoner på 26,7 kb
- Protein
- 541 aminosyror
- Även känd som
- GLUT10, GLUT-10
- MANE Select-transkript
- ENST00000359271.4NM_030777.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc2a10.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SLC2A10, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Cutis laxa
Cutis laxa (CL) är en ärftlig eller förvärvad bindvävssjukdom som kännetecknas av skrynklig, överflödig och slapp, oelastisk hud i kombination med skelett- och utvecklingsavvikelser och, i vissa fall, allvarligt engagemang av flera organsystem. Flera olika former av ärftlig CL har beskrivits. De skiljs åt utifrån arvsgången samt skillnader i hur omfattande engagemanget av inre organ är, vilka tillhörande avvikelser som förekommer och hur allvarlig sjukdomen är.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 6 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är SLC2A10 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,2 kb av genens 26,7 kb, och 1 626 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SLC2A10
3Låg
Hur svår SLC2A10 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av SLC2A10s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.9,4 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.15 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
46
positioner i SLC2A10 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 26,7 kb av SLC2A10, inklusive introner, inte bara de 4,2 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Delar 1 tillstånd
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Delar 1 tillstånd
- ATP6V1AATPase H+ transporting V1 subunit ADelar 1 tillstånd
- ATP6V1E1ATPase H+ transporting V1 subunit E1Delar 1 tillstånd
- ATP7AATPase copper transporting alphaDelar 1 tillstånd
- EFEMP1EGF-like fibulin extracellular matrix protein 1Delar 1 tillstånd
- EFEMP2EGF-like fibulin extracellular matrix protein 2Delar 1 tillstånd
- ELNelastinDelar 1 tillstånd
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Delar 1 tillstånd
- FBLN5fibulin 5Delar 1 tillstånd
- GORABgolgin, RAB6 interactingDelar 1 tillstånd
- LTBP1latent transforming growth factor beta binding protein 1Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SLC2A10
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC2A10 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the cardiovascular system
- Generalized twisted arteries
- Abnormal carotid artery morphology
- Aneurysm
- Aortic tortuosity
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Cardiac failure
- Narrowing of an artery
Visa ytterligare 16 egenskaper
- Telangiectasia of the skin
- Narrowing of aortic valve
- Narrowing of lung artery
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Abnormal myocardium morphology
- Carotid artery dissection
- Enlarged and thickened heart muscle
- Heart attack
- Heart stops beating
- High blood pressure
- Inflammation of heart muscle
- Stretched and thinned heart muscle
- Aortic regurgitation
- Ischemic stroke
- Telangiectases of the cheeks
- Ventricular hypertrophy
Abnormality of the musculoskeletal system
- Double-Jointed
- Congenital diaphragmatic hernia
- Abnormal formation of the hip
- Funnel chest
- Low muscle tone
- Pigeon chest
- Scoliosis
- Flexed joint that cannot be straightened
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SLC2A10-genen: solute carrier family 2 member 10. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc2a10
Dante Labs. SLC2A10-genen: solute carrier family 2 member 10 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc2a10
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor