Genă
STAT1
signal transducer and activator of transcription 1
- HGNC 11362↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000115415↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 6772↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 2q32.2
- Coordonate
- Cromozomul 2: 190.969.149–191.014.171 (GRCh38)
- Exoni
- 25 de exoni pe 45 kb
- Proteină
- 750 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- STAT91, ISGF-3
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000361099.8NM_007315.4
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/stat1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți STAT1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Boli autoimune
Tulburare care rezultă din pierderea funcției sau din distrugerea țesutului unui organ sau a mai multor organe, cauzată de răspunsurile imune umorale sau celulare ale organismului împotriva propriilor constituenți tisulari. Poate fi sistemică (de exemplu, lupusul eritematos sistemic) sau specifică unui organ (de exemplu, tiroidita).
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Candidoză mucocutanată cronică
Infecții persistente sau recurente cu Candida ale pielii, unghiilor și mucoaselor, cauzate de modificări ale unor gene precum STAT1, IL17RA, IL17RC, IL17F și TRAF3IP2.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Cunoașterea cauzei ghidează tratamentul antifungic pe termen lung și, în cazul gain-of-function al genei STAT1, monitorizarea pentru autoimunitate și anevrisme, precum și luarea în considerare a terapiei ținta cu inhibitori JAK.
Susceptibilitatea mendeliană la boli micobacteriene (MSMD)
- Deficit complet de STAT1Autozomal recesivă
Infecții micobacteriene severe și infecții virale cu potențial letal, cauzate de modificări la ambele copii ale genei STAT1.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 4 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
De obicei este necesară transplantarea de celule stem.
- Susceptibilitatea mendeliană la boli micobacteriene
Defecte ereditare ale căii IL-12/interferon-gamma, cauzate de gene precum IL12RB1, IL12B, IFNGR1, IFNGR2, STAT1, IRF8, ISG15 și RORC.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 3 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Persoanele afectate și rudele aflate în risc ar trebui să evite vaccinul BCG și alte vaccinuri vii; infecțiile necesită tratament prelungit, iar unele forme răspund la interferon-gamma.
Boala prin câștig de funcție STAT1 și STAT3
- Boala prin câștig de funcție STAT1 cu autoimunitateAutozomal dominantă
Enteropatie, autoimunitate endocrină, infecții bacteriene și fungice și statură scundă, cauzate de o modificare activatoare a STAT1.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Inhibitorii JAK pot controla simptomele, iar monitorizarea pentru anevrisme și infecții este recomandată.
Grupări mai largi
Alte erori înnăscute ale imunității
- Imunodeficiență primară
Una dintre cele 114 gene legate de ea
Tulburări ereditare ale sistemului imunitar, cauzate de modificări ale unor gene individuale, care afectează modul în care organismul combate infecțiile sau reglează inflamația.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
- Boală de imunodeficiență
Una dintre cele 170 gene legate de ea
Boală în care există o deficiență sau un defect al mecanismelor imunității, fie celulare, fie umorale.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 4 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Transplant de celule stem hematopoietice (HSCT) pentru SCID și imunodeficiențe primare (PID) severe; substituție cu imunoglobuline (IVIG/SCIG) pentru deficiențele de anticorpi; leniolisib (Joenja, FDA 2023) pentru APDS; terapie genică pentru SCID-ADA; abatacept pentru deficiența CTLA4/LRBA; antibiotice profilactice; G-CSF pentru CGD
Structura genei STAT1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 4,1 kb din cei 45 kb ai genei; 2.253 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențierea STAT1
0Scăzut
Cât de greu este de secvențiat STAT1 cu citiri scurte, din 100Fiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale STAT1 aflate în acest tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează în funcție de cât de mult afectează fiecare dintre ele apelul din citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în nicio regiune, 100 când fiecare bază se află în toate.
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Greutate 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Greutate 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Greutate 15 %.0,4 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, zone pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Greutate 10 %.3,7 %
- Acoperirea referințeiGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există nicio secvență la care citirile să se poată alinia. Greutate 10 %.0 %
66
poziții în STAT1 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre acestea nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
Un genom întreg acoperă toți cei 45 kb ai lui STAT1, inclusiv intronii, nu doar cei 4,1 kb de exoni.
Gene asociate acelorași afecțiuni
- C1QAcomplement C1q A chainAre 3 de afecțiuni în comun
- IL17RAinterleukin 17 receptor AAre 3 de afecțiuni în comun
- STAT3signal transducer and activator of transcription 3Are 3 de afecțiuni în comun
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseAre 2 de afecțiuni în comun
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Are 2 de afecțiuni în comun
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorAre 2 de afecțiuni în comun
- BCL11BBCL11 transcription factor BAre 2 de afecțiuni în comun
- BLNKB cell linkerAre 2 de afecțiuni în comun
- BTKBruton tyrosine kinaseAre 2 de afecțiuni în comun
- C1QBcomplement C1q B chainAre 2 de afecțiuni în comun
- C1QCcomplement C1q C chainAre 2 de afecțiuni în comun
- C1Scomplement C1sAre 2 de afecțiuni în comun
Trăsături asociate cu STAT1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca STAT1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent mucocutaneous candidiasis
- BCGitis
- Coccidioidomycosis
- Eczema
- Immune dysregulation
- Inflammatory abnormality of the skin
- Recurrent infections
Afișați încă 14 de trăsături
- Recurrent mycobacterium avium complex infections
- Recurrent viral infections
- Severe Histoplasma capsulatum infection
- Susceptibility to herpesvirus
- Abnormal circulating interferon-gamma concentration
- Antiphospholipid antibody positivity
- Bone infection
- Brain inflammation
- Recurrent Aspergillus infection
- Recurrent vulvovaginal candidiasis
- Unusual fungal nail infection
- HSV encephalitis
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent respiratory infections
Abnormality of the cardiovascular system
- Brain aneurysm
- Carotid artery dilatation
- Enlarged liver and spleen
- Increased spleen size
- Narrowing of kidney artery
- Renovascular hypertension
- Swollen lymph nodes
- Cardiac failure
Afișați încă 3 de trăsături
Abnormality of the digestive system
- Abnormality of the intestine
- Diarrhea
- Enlarged liver
- Enterocolitis
- Intussusception
- Protein-losing enteropathy
- Villous atrophy
- Esophageal carcinoma
Afișați încă 2 de trăsături
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-17: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.17-8666dff2.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena STAT1: signal transducer and activator of transcription 1. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/stat1
Dante Labs. Gena STAT1: signal transducer and activator of transcription 1 [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/stat1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni