Gen
STAT1
signal transducer and activator of transcription 1
- HGNC 11362↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000115415↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 6772↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2q32.2
- Koordinater
- Kromosom 2: 190.969.149–191.014.171 (GRCh38)
- Exoner
- 25 exoner fordelt over 45 kb
- Protein
- 750 aminosyrer
- Også kendt som
- STAT91, ISGF-3
- MANE Select-transkript
- ENST00000361099.8NM_007315.4
- Lokustype
- Protein-coding
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/stat1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs STAT1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Autoimmun sygdom
En lidelse, der skyldes tab af funktion eller vævsnedbrydning i et organ eller flere organer, og som opstår ved humorale eller cellulære immunreaktioner hos det enkelte individ mod egne vævsbestanddele. Den kan være systemisk (f.eks. systemisk lupus erythematosus) eller organspecifik (f.eks. thyreoiditis).
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Kronisk mukokutan candidiasis
Vedvarende eller tilbagevendende Candida-infektioner i hud, negle og slimhinder forårsaget af ændringer i gener såsom STAT1, IL17RA, IL17RC, IL17F og TRAF3IP2.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Kendskab til årsagen vejleder langvarig antifungal behandling og, ved STAT1-gain-of-function, overvågning for autoimmunitet og aneurismer samt overvejelse af målrettet JAK-hæmmerbehandling.
Mendelsk modtagelighed for mykobakterielle sygdomme (MSMD)
- Komplet STAT1-mangelAutosomal recessiv
Alvorlige mykobakterielle infektioner og livstruende virusinfektioner forårsaget af ændringer i begge kopier af STAT1.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Der er som regel behov for stamcelletransplantation.
- Mendelsk modtagelighed for mykobakterielle sygdomme
Arvelige defekter i IL-12/interferon-gamma-signalvejen, forårsaget af gener såsom IL12RB1, IL12B, IFNGR1, IFNGR2, STAT1, IRF8, ISG15 og RORC.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Berørte personer og risikopersoner blandt slægtninge bør undgå BCG og andre levende vacciner. Infektioner kræver langvarig behandling, og nogle former reagerer på interferon-gamma.
Sygdomme med gain-of-function i STAT1 og STAT3
- Sygdom med gain-of-function i STAT1 og autoimmunitetAutosomal dominant
Enteropati, endokrin autoimmunitet, bakterielle og svampeinfektioner og lav statur forårsaget af en aktiverende ændring i STAT1.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
JAK-hæmmere kan kontrollere symptomerne, og kontrol for aneurysmer og infektioner anbefales.
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsvigt
- Medfødt immundefekt
Et af 114 gener, der er knyttet til det
Arvelige sygdomme i immunsystemet, forårsaget af ændringer i enkelte gener, som påvirker kroppens evne til at bekæmpe infektioner eller regulere inflammation.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Immunsvigtsygdom
Et af 170 gener, der er knyttet til det
Sygdom, hvor der er mangel på eller defekt i immunforsvarets mekanismer, enten cellulære eller humorale.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
HSCT ved SCID og alvorlige PID'er; immunglobulinbehandling (IVIG/SCIG) ved antistofmangel; leniolisib (Joenja, FDA 2023) ved APDS; genterapi ved ADA-SCID; abatacept ved CTLA4-/LRBA-mangel; profylaktiske antibiotika; G-CSF ved CGD
Sådan er STAT1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 4,1 kb af genets 45 kb; 2.253 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af STAT1
66
positioner i STAT1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved at dække.
En helgenomsanalyse dækker alle 45 kb af STAT1, inklusive introner, og ikke kun de 4,1 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- C1QAcomplement C1q A chainDeler 3 sygdomme
- IL17RAinterleukin 17 receptor ADeler 3 sygdomme
- STAT3signal transducer and activator of transcription 3Deler 3 sygdomme
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeler 2 sygdomme
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 2 sygdomme
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDeler 2 sygdomme
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeler 2 sygdomme
- BLNKB cell linkerDeler 2 sygdomme
- BTKBruton tyrosine kinaseDeler 2 sygdomme
- C1QBcomplement C1q B chainDeler 2 sygdomme
- C1QCcomplement C1q C chainDeler 2 sygdomme
- C1Scomplement C1sDeler 2 sygdomme
Træk knyttet til STAT1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, STAT1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent mucocutaneous candidiasis
- BCGitis
- Coccidioidomycosis
- Eczema
- Immune dysregulation
- Inflammatory abnormality of the skin
- Recurrent infections
Vis 14 træk mere
- Recurrent mycobacterium avium complex infections
- Recurrent viral infections
- Severe Histoplasma capsulatum infection
- Susceptibility to herpesvirus
- Abnormal circulating interferon-gamma concentration
- Antiphospholipid antibody positivity
- Bone infection
- Brain inflammation
- Recurrent Aspergillus infection
- Recurrent vulvovaginal candidiasis
- Unusual fungal nail infection
- HSV encephalitis
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent respiratory infections
Abnormality of the digestive system
- Abnormality of the intestine
- Diarrhea
- Enlarged liver
- Enterocolitis
- Intussusception
- Protein-losing enteropathy
- Villous atrophy
- Esophageal carcinoma
Vis 2 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). STAT1-genet: signal transducer and activator of transcription 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/stat1
Dante Labs. STAT1-genet: signal transducer and activator of transcription 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/stat1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger