Gene
STAT1
signal transducer and activator of transcription 1
- HGNC 11362↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000115415↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 6772↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 2q32.2
- Coordinate
- Cromosoma 2: 190.969.149–191.014.171 (GRCh38)
- Esoni
- 25 esoni su 45 kb
- Proteina
- 750 amminoacidi
- Noto anche come
- STAT91, ISGF-3
- Trascritto MANE Select
- ENST00000361099.8NM_007315.4
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Questa pagina come dati
Aggiunga .json all'indirizzo della pagina, oppure richieda application/json, per leggerla come JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/stat1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLegga STAT1 e il resto del suo genoma con un unico test.
A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane
Ottieni il mio Genome TestReport curati rilevanti per questo gene
Malattia autoimmune
Un disturbo derivante dalla perdita di funzione o dalla distruzione tissutale di uno o più organi, causato da risposte immunitarie umorali o cellulari dell'individuo dirette contro i costituenti dei propri tessuti. Può essere sistemico (ad es. lupus eritematoso sistemico) oppure organo-specifico (ad es. tiroidite).
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
Candidosi mucocutanea cronica
Infezioni da Candida persistenti o ricorrenti a carico della pelle, delle unghie e delle mucose, causate da alterazioni di geni come STAT1, IL17RA, IL17RC, IL17F e TRAF3IP2.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Conoscere la causa orienta il trattamento antimicotico a lungo termine e, in caso di guadagno di funzione di STAT1, il monitoraggio per le malattie autoimmuni e gli aneurismi, nonché la valutazione di una terapia mirata con inibitori di JAK.
Suscettibilità mendeliana alle malattie micobatteriche (MSMD)
- Deficit completo di STAT1Autosomica recessiva
Infezioni micobatteriche gravi e infezioni virali potenzialmente letali causate da alterazioni in entrambe le copie di STAT1.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Di solito è necessario un trapianto di cellule staminali.
- Suscettibilità mendeliana alle malattie micobatteriche
Difetti ereditari della via IL-12/interferone gamma, causati da geni come IL12RB1, IL12B, IFNGR1, IFNGR2, STAT1, IRF8, ISG15 e RORC.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 3 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Le persone affette e i familiari a rischio dovrebbero evitare il BCG e altri vaccini vivi; le infezioni richiedono un trattamento prolungato e alcune forme rispondono all'interferone gamma.
Malattia da guadagno di funzione di STAT1 e STAT3
- Malattia da guadagno di funzione di STAT1 con autoimmunitàAutosomica dominante
Enteropatia, autoimmunità endocrina, infezioni batteriche e fungine e bassa statura causate da una variante attivante di STAT1.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Gli inibitori di JAK possono controllare i sintomi, ed è consigliato il monitoraggio per aneurismi e infezioni.
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Immunodeficienza primaria
Uno di 114 geni collegati ad esso
Malattie ereditarie del sistema immunitario causate da alterazioni di singoli geni, che influiscono sul modo in cui l'organismo combatte le infezioni o regola l'infiammazione.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Malattia da immunodeficienza
Uno di 170 geni collegati ad esso
Malattia caratterizzata da un deficit o da un'anomalia nei meccanismi dell'immunità, sia essa cellulare o umorale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
HSCT per SCID e PID gravi; terapia sostitutiva con immunoglobuline (IVIG/SCIG) per i deficit anticorpali; leniolisib (Joenja, FDA 2023) per APDS; terapia genica per ADA-SCID; abatacept per il deficit di CTLA4/LRBA; profilassi antibiotica; G-CSF per CGD
Struttura di STAT1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 4,1 kb dei 45 kb del gene; 2253 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento STAT1
0Facile
Quanto è difficile sequenziare STAT1 con letture corte, su 100
0 · Facile100 · Difficile
Quasi tutti gli esoni di STAT1 si trovano in punti in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.
Cosa aggrava il quadro: la quota degli esoni di STAT1 in ciascun tipo di regione difficile
- MappabilitàTratti in cui letture di 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, per cui una chiamata in quel punto può mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una sola base, su cui le letture scivolano e che potrebbero non coprire per intero. Peso 15%.0,4%
- Contenuto GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre in modo scarso. Peso 10%.3,7%
- Copertura del riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento nelle vicinanze, dove non c'è sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Un punteggio Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare Genome in a Bottle del NIST.Come viene calcolato il punteggioOgni barra indica la quota delle basi esoniche di STAT1 in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in alcuna regione, 100 quando ogni base si trova in tutte.
66
posizioni in STAT1 in cui ClinVar classifica una variazione come patogenica o probabilmente patogenica
Nessuna di esse ricade in una regione difficile da leggere con letture corte.
Un genoma intero copre tutti i 45 kb di STAT1, introni inclusi, e non solo i 4,1 kb di esoni.
ClinVar pathogenic variants (69)
The STAT1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogena 36
- Patogena/probabilmente patogena 2
- Probabilmente patogena 31
| Variante | Conditions | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|
| NM_007315.4(STAT1):c.1154C>T (p.Thr385Met) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.821G>A (p.Arg274Gln) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.820C>T (p.Arg274Trp) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.800C>T (p.Ala267Val) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 3 others | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.1310C>T (p.Thr437Ile) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.820C>G (p.Arg274Gly) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.970T>C (p.Cys324Arg) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.876C>A (p.Asp292Glu) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.511G>A (p.Asp171Asn) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_007315.4(STAT1):c.2102A>G (p.Tyr701Cys) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1999_2000del (p.Leu667fs) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1833del (p.Ile612fs) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1688A>T (p.Glu563Val) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1398C>A (p.Ser466Arg) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1286_1287del (p.Glu429fs) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1239_1240insT (p.Asn414Ter) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1231_1232del (p.Glu411fs) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1162A>G (p.Lys388Glu) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1162A>C (p.Lys388Gln) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1159A>G (p.Thr387Ala) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1127+1G>A (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.1011_1012del (p.Val339fs) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.961A>G (p.Arg321Gly) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.895_896insT (p.Gln299fs) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_007315.4(STAT1):c.866A>G (p.Tyr289Cys) (opens in a new tab) | Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to partial STAT1 deficiency and 2 others | Patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
See all 69 with every other STAT1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Geni associati alle stesse condizioni
- C1QAcomplement C1q A chainCondivide 3 condizioni
- IL17RAinterleukin 17 receptor ACondivide 3 condizioni
- STAT3signal transducer and activator of transcription 3Condivide 3 condizioni
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseCondivide 2 condizioni
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Condivide 2 condizioni
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorCondivide 2 condizioni
- BCL11BBCL11 transcription factor BCondivide 2 condizioni
- BLNKB cell linkerCondivide 2 condizioni
- BTKBruton tyrosine kinaseCondivide 2 condizioni
- C1QBcomplement C1q B chainCondivide 2 condizioni
- C1QCcomplement C1q C chainCondivide 2 condizioni
- C1Scomplement C1sCondivide 2 condizioni
Tratti collegati a STAT1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che STAT1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent mucocutaneous candidiasis
- BCGitis
- Coccidioidomycosis
- Eczema
- Immune dysregulation
- Inflammatory abnormality of the skin
- Recurrent infections
Mostra altri 14 tratti
- Recurrent mycobacterium avium complex infections
- Recurrent viral infections
- Severe Histoplasma capsulatum infection
- Susceptibility to herpesvirus
- Abnormal circulating interferon-gamma concentration
- Antiphospholipid antibody positivity
- Bone infection
- Brain inflammation
- Recurrent Aspergillus infection
- Recurrent vulvovaginal candidiasis
- Unusual fungal nail infection
- HSV encephalitis
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent respiratory infections
Abnormality of the digestive system
- Abnormality of the intestine
- Diarrhea
- Enlarged liver
- Enterocolitis
- Intussusception
- Protein-losing enteropathy
- Villous atrophy
- Esophageal carcinoma
Mostra altri 2 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati nel 2026-10-18: le condizioni a cui il gene è associato e il grado di associazione.
- L'elenco ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: i siti noti che causano malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.18-8b139e39.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene STAT1: signal transducer and activator of transcription 1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/stat1
Dante Labs. Gene STAT1: signal transducer and activator of transcription 1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/stat1
Un solo test. Risposte per tutta la vita.
A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane