Gen
STAT1
signal transducer and activator of transcription 1
- HGNC 11362↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000115415↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6772↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 2q32.2
- Souřadnice
- Chromozom 2: 190 969 149–191 014 171 (GRCh38)
- Exony
- 25 exonů na 45 kb
- Protein
- 750 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní Autozomálně recesivní
- Další názvy
- STAT91, ISGF-3
- Transkript MANE Select
- ENST00000361099.8NM_007315.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si STAT1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Autoimmune Disease
A disorder resulting from loss of function or tissue destruction of an organ or multiple organs, arising from humoral or cellular immune responses of the individual to their own tissue constituents. It may be systemic (e.g., systemic lupus erythematosus), or organ specific, (e.g., thyroiditis).
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Chronic Mucocutaneous Candidiasis
Persistent or recurrent Candida infections of the skin, nails and mucous membranes caused by changes in genes such as STAT1, IL17RA, IL17RC, IL17F and TRAF3IP2.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing the cause guides long-term antifungal treatment and, for STAT1 gain-of-function, monitoring for autoimmunity and aneurysms and consideration of targeted JAK-inhibitor therapy.
Mendelian Susceptibility to Mycobacterial Disease (MSMD)
- Complete STAT1 deficiencyAutozomálně recesivní
Severe mycobacterial and life-threatening viral infections caused by changes in both copies of STAT1.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Stem cell transplantation is usually needed.
- Mendelian susceptibility to mycobacterial disease
Inherited defects in the IL-12/interferon-gamma pathway, caused by genes such as IL12RB1, IL12B, IFNGR1, IFNGR2, STAT1, IRF8, ISG15 and RORC.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Affected people and at-risk relatives should avoid BCG and other live vaccines, infections need prolonged treatment, and some forms respond to interferon-gamma.
STAT1 and STAT3 Gain-of-Function Disease
- STAT1 gain-of-function disease with autoimmunityAutozomálně dominantní
Enteropathy, endocrine autoimmunity, bacterial and fungal infections and short stature caused by an activating STAT1 change.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
JAK inhibitors can control symptoms, and monitoring for aneurysms and infections is advised.
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
Jeden z 114 genů spojených s touto vazbou
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je STAT1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,1 kb z 45 kb genu; 2 253 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte STAT1
66
pozic v genu STAT1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 45 kb genu STAT1, včetně intronů, nikoli jen 4,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- C1QAcomplement C1q A chainSdílí 3 onemocnění
- IL17RAinterleukin 17 receptor ASdílí 3 onemocnění
- STAT3signal transducer and activator of transcription 3Sdílí 3 onemocnění
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 2 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 2 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 2 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 2 onemocnění
- BLNKB cell linkerSdílí 2 onemocnění
- BTKBruton tyrosine kinaseSdílí 2 onemocnění
- C1QBcomplement C1q B chainSdílí 2 onemocnění
- C1QCcomplement C1q C chainSdílí 2 onemocnění
- C1Scomplement C1sSdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s STAT1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit STAT1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent mucocutaneous candidiasis
- BCGitis
- Coccidioidomycosis
- Eczema
- Immune dysregulation
- Inflammatory abnormality of the skin
- Recurrent infections
Zobrazit ještě 14 rysů
- Recurrent mycobacterium avium complex infections
- Recurrent viral infections
- Severe Histoplasma capsulatum infection
- Susceptibility to herpesvirus
- Abnormal circulating interferon-gamma concentration
- Antiphospholipid antibody positivity
- Bone infection
- Brain inflammation
- Recurrent Aspergillus infection
- Recurrent vulvovaginal candidiasis
- Unusual fungal nail infection
- HSV encephalitis
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent respiratory infections
Abnormality of the digestive system
- Abnormality of the intestine
- Diarrhea
- Enlarged liver
- Enterocolitis
- Intussusception
- Protein-losing enteropathy
- Villous atrophy
- Esophageal carcinoma
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen STAT1: signal transducer and activator of transcription 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/stat1
Dante Labs. Gen STAT1: signal transducer and activator of transcription 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/stat1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů