Gen
SLX4
SLX4 structure-specific endonuclease subunit
- HGNC 23845↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000188827↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 84464↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 16p13.3
- Współrzędne
- Chromosom 16: 3 581 181–3 611 606 (GRCh38)
- Eksony
- 15 eksonów na odcinku 30,4 kb
- Białko
- 1834 aminokwasów
- Znany również jako
- KIAA1784, KIAA1987, FANCP
- Poprzednie symbole
- BTBD12
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000294008.4NM_032444.4
- Typ locus
- Protein-coding
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slx4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj SLX4 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Choroba naprawy DNA
- Autosomalne recesywne
Choroba, której podłożem jest zaburzenie mechanizmów naprawy DNA.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Anemia Fanconiego
- Autosomalne recesywne
Anemia Fanconiego (FA) to dziedziczne zaburzenie naprawy DNA, charakteryzujące się postępującą pancytopenią z niewydolnością szpiku kostnego, zmiennymi wrodzonymi wadami rozwojowymi oraz predyspozycją do rozwoju nowotworów krwi lub nowotworów litych.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Przeszczepienie krwiotwórczych komórek macierzystych z zastosowaniem schematu przygotowawczego o zmniejszonej intensywności, dostosowanego do FA; androgeny (oksymetolon) jako terapia pomostowa; nadzór onkologiczny nad nowotworami głowy i szyi oraz narządów rodnych; terapia genowa w badaniach klinicznych
Budowa genu SLX4
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 7,3 kb z 30,4 kb genu; 5505 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie SLX4
139
pozycje w genie SLX4, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, w którym krótkie odczyty mają trudności.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 30,4 kb genu SLX4, łącznie z intronami, a nie tylko 7,3 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedWspólnych schorzeń: 2
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedWspólnych schorzeń: 2
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Wspólnych schorzeń: 2
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitWspólnych schorzeń: 2
- FANCAFA complementation group AWspólnych schorzeń: 2
- FANCBFA complementation group BWspólnych schorzeń: 2
- FANCCFA complementation group CWspólnych schorzeń: 2
- FANCD2FA complementation group D2Wspólnych schorzeń: 2
- FANCEFA complementation group EWspólnych schorzeń: 2
- FANCFFA complementation group FWspólnych schorzeń: 2
- FANCGFA complementation group GWspólnych schorzeń: 2
- FANCIFA complementation group IWspólnych schorzeń: 2
Cechy powiązane z genem SLX4
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SLX4. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Abnormal aortic morphology
- Abnormal aortic valve morphology
- Abnormal carotid artery morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Arteriovenous malformation
- Enlarged and thickened heart muscle
- Patent ductus arteriosus
Pokaż jeszcze 1 cechę
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SLX4: SLX4 structure-specific endonuclease subunit. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/slx4
Dante Labs. Gen SLX4: SLX4 structure-specific endonuclease subunit [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/slx4
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni