Genas
FOXN1
forkhead box N1
- HGNC 12765↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000109101↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 8456↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 17q11.2
- Koordinatės
- Chromosoma 17: 28 506 348–28 538 900 (GRCh38)
- Eksonai
- 9 eksonų per 32,6 kb
- Baltymas
- 648 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Taip pat žinomas kaip
- FKHL20
- Ankstesni simboliai
- WHN, RONU
- MANE Select transkriptas
- ENST00000579795.6NM_001369369.1
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite FOXN1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Teži kombinuotas imunodeficitas
- Autosominis recesyvinis
Teži kombinuotas imunodeficitas (SCID) – tai retų monogeninių pirminių imunodeficitų grupė, kuriai būdingas funkcinių periferinių T limfocitų trūkumas, sukeliantis ankstyvas sunkias kvėpavimo takų infekcijas ir nepakankamą vaikų augimą bei vystymąsi. Pagal imunologinį fenotipą jie skirstomi į SCID, kai nėra T ląstelių, bet yra B ląstelių (T-B+ SCID), ir SCID, kai nėra abiejų (T-B- SCID). Abi šios grupės apima kelias formas, su natūraliųjų žudikų (NK) ląstelėmis arba be jų.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Platesnės grupės
Kiti įgimti imunodeficitai
- Imunodeficito liga
Vienas iš 170 su juo susijusių genų
Liga, kai sutrikusi arba nepakankamai išsivysčiusi imuninė apsauga – tiek ląstelinė, tiek humoralinė.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
HSCT (hematopoetinių kamieninių ląstelių transplantacija) taikoma SCID ir sunkioms pirminėms imunodeficito ligoms gydyti; imunoglobulinų papildymas (IVIG/SCIG) – antikūnų nepakankamumui; leniolisibas (Joenja, FDA 2023) – APDS; genų terapija – ADA-SCID; abatacepto – CTLA4 ir LRBA nepakankamumui; profilaktiniai antibiotikai; G-CSF – CGD
Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Reikia pakitusio egzemplioriaus iš kiekvieno iš tėvų. Turint vieną, esate nešiotojas ir paprastai neturite požymių; kai abu tėvai yra nešiotojai, kiekvienas vaikas su vienos iš keturių tikimybe paveldės du.
Kaip išdėstytas FOXN1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 3,5 kb iš 32,6 kb geno; 1 947 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito FOXN1
70
FOXN1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 32,6 kb FOXN1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 3,5 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (29)
Čia pateikiami FOXN1 variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| C82X | c.246C>A | Eksonas 3 | 28 524 625 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| D313Tfs*169 | c.933_936dup | Eksonas 7 | 28 534 334 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| E303Sfs*247 | c.907del | Eksonas 6 | 28 530 823 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| E390Kfs*160 | c.1168del | Eksonas 8 | 28 534 738 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| G337Efs*213 | c.1010del | Eksonas 7 | 28 534 411 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| H321R | c.962A>G | Eksonas 7 | 28 534 365 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| H457Pfs*93 | c.1370del | Eksonas 8 | 28 534 940 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| I433Ffs*117 | c.1296del | Eksonas 8 | 28 534 863 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| L325P | c.974T>C | Eksonas 7 | 28 534 377 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| L426Tfs*123 | c.1275_1278del | Eksonas 8 | 28 534 840 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ADAadenosine deaminaseTuri 2 bendrų būklių
- AK2adenylate kinase 2Turi 2 bendrų būklių
- BCL11BBCL11 transcription factor BTuri 2 bendrų būklių
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Turi 2 bendrų būklių
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Turi 2 bendrų būklių
- CD247CD247 moleculeTuri 2 bendrų būklių
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexTuri 2 bendrų būklių
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexTuri 2 bendrų būklių
- CD70CD70 moleculeTuri 2 bendrų būklių
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorTuri 2 bendrų būklių
- CORO1Acoronin 1ATuri 2 bendrų būklių
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CTuri 2 bendrų būklių
Savybės, susijusios su FOXN1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti FOXN1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the immune system
- Recurrent viral infections
- Cellular immunodeficiency
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Severe T-cell immunodeficiency
- Autoimmunity
- Opportunistic infection
- Pneumonia
Rodyti dar 15 savybių
- Recurrent bacterial infections
- Severe infection
- Severe viral infection
- Baby eczema
- Combined immunodeficiency
- Eczema
- Infection in blood stream
- Invasive fungal infection
- Meningitis
- Recurrent Candida infection
- Recurrent Staphylococcus aureus infection
- Recurrent streptococcus pneumoniae infections
- Pus-filled lesion
- Recurrent infections in bronchi and lungs
- Recurrent pneumonia
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). FOXN1 genas: forkhead box N1. Pasiekta 2026 m. spalio 16 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/foxn1
Dante Labs. FOXN1 genas: forkhead box N1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 16 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/foxn1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites