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Gene

TAF4

TATA-box binding protein associated factor 4

Sintesi

Localizzazione citogenetica
20q13.33
Coordinate
Cromosoma 20: 61.974.798–62.065.881 (GRCh38)
Esoni
15 esoni su 91,1 kb
Proteina
1085 amminoacidi
Noto anche come
TAFII130, TAFII135
Simboli precedenti
TAF4A, TAF2C1, TAF2C
Trascritto MANE Select
ENST00000252996.9NM_003185.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curato rilevante per questo gene

    Struttura di TAF4

    • Sequenza codificante
    • Regione non tradotta
    • Introne
    • Direzione della trascrizione
    • Siti noti causativi di malattia
    • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
    Cromosoma 20, con una parentesi dove si trova TAF4. TAF4 e 13 geni nelle vicinanze sul cromosoma 20, da 61.520.340 a 62.520.339.Cromosoma 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3361,6 Mb61,8 Mb62 Mb62,2 Mb62,4 MbCDH4: 61.252.208–61.940.617, filamento direttoCDH4TAF4: 61.974.798–62.065.881, filamento inversoTAF4LSM14B: 62.122.417–62.136.728, filamento direttoLSM14BPSMA7: 62.136.725–62.143.470, filamento inversoPSMA7SS18L1: 62.143.606–62.182.514, filamento direttoSS18L1MTG2: 62.183.005–62.203.571, filamento direttoMTG2HRH3: 62.214.960–62.220.303, filamento inversoHRH3OSBPL2: 62.231.922–62.296.213, filamento direttoOSBPL2ADRM1: 62.302.046–62.308.867, filamento direttoADRM1LAMA5: 62.307.955–62.367.333, filamento inversoLAMA5RPS21: 62.365.598–62.388.680, filamento direttoRPS21CABLES2: 62.388.630–62.407.319, filamento inversoCABLES2RBBP8NL: 62.410.143–62.427.548, filamento inversoRBBP8NLGATA5: 62.463.481–62.476.094, filamento inversoGATA5Diagramma di TAF4: 15 esoni sul filamento inverso del cromosoma 20Esone 15: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 11: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 9: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 3: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 12 siti noti causativi di malattiaEsone 15: 61.974.798–61.976.335, 1538 basiEsone 14: 61.997.550–61.997.669, 120 basiEsone 13: 61.998.136–61.998.192, 57 basiEsone 12: 61.998.983–61.999.108, 126 basiEsone 11: 62.000.124–62.000.254, 131 basiEsone 10: 62.000.552–62.000.721, 170 basiEsone 9: 62.003.160–62.003.274, 115 basiEsone 8: 62.003.731–62.003.878, 148 basiEsone 7: 62.006.510–62.006.758, 249 basiEsone 6: 62.007.547–62.007.636, 90 basiEsone 5: 62.009.052–62.009.174, 123 basiEsone 4: 62.010.046–62.010.165, 120 basiEsone 3: 62.012.815–62.012.934, 120 basiEsone 2: 62.014.547–62.014.707, 161 basiEsone 1: 62.064.451–62.065.881, 1431 basi1510515′3′

    Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

    Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

    Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

    Gli esoni costituiscono 4,7 kb dei 91,1 kb del gene; 3258 di queste basi codificano la proteina.

    Come un test genomico legge TAF4

    17

    posizioni in TAF4 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

    Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

    Un genoma intero copre tutti i 91,1 kb di TAF4, introni inclusi, non solo i 4,7 kb di esoni.

    Da dove provengono questi dati

    • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
    • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
    • GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
    • La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
    • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
    • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
    • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

    Cita questa pagina

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gene TAF4: TATA-box binding protein associated factor 4. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/taf4

    Vancouver

    Dante Labs. Gene TAF4: TATA-box binding protein associated factor 4 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/taf4

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