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Gène

TAF4

TATA-box binding protein associated factor 4

Résumé

Localisation cytogénétique
20q13.33
Coordonnées
Chromosome 20 : 61 974 798–62 065 881 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 91,1 kb
Protéine
1 085 acides aminés
Aussi appelé
TAFII130, TAFII135
Symboles précédents
TAF4A, TAF2C1, TAF2C
Transcrit MANE Select
ENST00000252996.9NM_003185.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    Structure de TAF4

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de TAF4. TAF4 et 13 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 61 520 340 à 62 520 339.Chromosome 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3361,6 Mb61,8 Mb62 Mb62,2 Mb62,4 MbCDH4 : 61 252 208–61 940 617, brin directCDH4TAF4 : 61 974 798–62 065 881, brin inverseTAF4LSM14B : 62 122 417–62 136 728, brin directLSM14BPSMA7 : 62 136 725–62 143 470, brin inversePSMA7SS18L1 : 62 143 606–62 182 514, brin directSS18L1MTG2 : 62 183 005–62 203 571, brin directMTG2HRH3 : 62 214 960–62 220 303, brin inverseHRH3OSBPL2 : 62 231 922–62 296 213, brin directOSBPL2ADRM1 : 62 302 046–62 308 867, brin directADRM1LAMA5 : 62 307 955–62 367 333, brin inverseLAMA5RPS21 : 62 365 598–62 388 680, brin directRPS21CABLES2 : 62 388 630–62 407 319, brin inverseCABLES2RBBP8NL : 62 410 143–62 427 548, brin inverseRBBP8NLGATA5 : 62 463 481–62 476 094, brin inverseGATA5Schéma de TAF4 : 15 exons sur le brin inverse du chromosome 20Exon 15 : 1 site connu associé à une maladieExon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 12 sites connus associés à une maladieExon 15 : 61 974 798–61 976 335, 1 538 basesExon 14 : 61 997 550–61 997 669, 120 basesExon 13 : 61 998 136–61 998 192, 57 basesExon 12 : 61 998 983–61 999 108, 126 basesExon 11 : 62 000 124–62 000 254, 131 basesExon 10 : 62 000 552–62 000 721, 170 basesExon 9 : 62 003 160–62 003 274, 115 basesExon 8 : 62 003 731–62 003 878, 148 basesExon 7 : 62 006 510–62 006 758, 249 basesExon 6 : 62 007 547–62 007 636, 90 basesExon 5 : 62 009 052–62 009 174, 123 basesExon 4 : 62 010 046–62 010 165, 120 basesExon 3 : 62 012 815–62 012 934, 120 basesExon 2 : 62 014 547–62 014 707, 161 basesExon 1 : 62 064 451–62 065 881, 1 431 bases1510515′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 4,7 kb sur les 91,1 kb du gène ; 3 258 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit TAF4

    17

    positions dans TAF4 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

    Un génome entier couvre les 91,1 kb de TAF4, introns compris, et pas seulement les 4,7 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène TAF4 : TATA-box binding protein associated factor 4. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/taf4

    Vancouver

    Dante Labs. Gène TAF4 : TATA-box binding protein associated factor 4 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/taf4

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