Gén
PIGQ
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Q
- HGNC 14135↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000007541↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 9091↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 16p13.3
- Koordináták
- 16. kromoszóma: 569 968–584 109 (GRCh38)
- Exonok
- 11 exon, összesen 14,1 kb
- Fehérje
- 581 aminosav
- Más néven ismert
- hGPI1, GPI1
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000321878.10NM_004204.5
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pigq.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a PIGQ-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
GPI Anchor Biosynthesis Defects
- Multiple Congenital Anomalies-Hypotonia-Seizures Syndrome
A group of GPI anchor defects (PIGN, PIGA, PIGT, PIGQ and related genes) with low muscle tone, seizures, developmental delay and congenital anomalies.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Disorders of GPI Anchor Biosynthesis
A group of inherited conditions caused by variants in the PIG, PGAP and related genes needed to make and attach the GPI anchor, typically causing developmental delay, low muscle tone and epilepsy.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
A 171 hozzá kapcsolódó gén egyike
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A PIGQ felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 14,1 kb-jából 3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1746 bázis kódolja a fehérjét.
PIGQ szekvenálása
19Közepes
Mennyire nehéz a PIGQ rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A PIGQ exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.
Ehhez hozzájárul: a PIGQ exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.0,9%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.96%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a PIGQ exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
41
a PIGQ azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a PIGQ mind a 14,1 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 3 kb exont.
ClinVar pathogenic variants (42)
The PIGQ variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 35
- Patogén/valószínűleg patogén 3
- Valószínűleg patogén 4
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_004204.5(PIGQ):c.49G>A (p.Gly17Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 77 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_004204.5(PIGQ):c.942+1G>A (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 77 and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_004204.5(PIGQ):c.1199_1201del (p.Tyr400del) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 77 and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_004204.5(PIGQ):c.52_70dup (p.Val24fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.68G>A (p.Trp23Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.69G>A (p.Trp23Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.91_106del (p.Val31fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.161_174del (p.Gln54fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.197G>A (p.Trp66Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.211C>T (p.Gln71Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.220G>T (p.Glu74Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.223G>T (p.Glu75Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.241del (p.Leu81fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 77 and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.254dup (p.Ala86fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.255dup (p.Ala86fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.418C>T (p.Gln140Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.449del (p.Arg150fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.532del (p.Ser178fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.551del (p.Gly184fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.573G>A (p.Trp191Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.618del (p.Arg206fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.619C>T (p.Arg207Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.637del (p.Cys213fs) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.688C>T (p.Arg230Ter) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004204.5(PIGQ):c.690-2A>G (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 77 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
See all 42 with every other PIGQ variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- PIGAphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class A3 betegséget oszt meg
- PIGBphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class B2 betegséget oszt meg
- PIGNphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N2 betegséget oszt meg
- PIGPphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class P2 betegséget oszt meg
- PIGSphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class S2 betegséget oszt meg
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class T2 betegséget oszt meg
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 betegséget oszt meg
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferase1 betegséget oszt meg
- ACTL6Bactin like 6B1 betegséget oszt meg
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 221 betegséget oszt meg
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A11 betegséget oszt meg
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit1 betegséget oszt meg
A(z) PIGQ génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PIGQ gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Multifocal seizures
- Myoclonic seizure
- Ventriculomegaly
- Epileptic encephalopathy
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Global developmental delay
Még 34 tulajdonság megjelenítése
- Intellectual disability
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- Focal tonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Increased reflexes
- Lethargy
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Fewer and broader ridges in brain
- Generalized clonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Grand mal seizures
- Infantile spasms
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Dystonia
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PIGQ gén: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Q. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pigq
Dante Labs. PIGQ gén: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Q [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pigq
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt