Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

JMJD8

jumonji domain containing 8

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
16p13.3
Koordináták
16. kromoszóma: 681 670–684 334 (GRCh38)
Exonok
9 exon, összesen 2,7 kb
Fehérje
264 aminosav
Korábbi jelölések
C16orf20
MANE Select transzkriptum
ENST00000609261.6NM_001005920.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) JMJD8 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A JMJD8 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Ismert betegségokozó helyek
16. kromoszóma, a JMJD8 helyét zárójel jelöli. A JMJD8 és környékén 40 gén a 16. kromoszómán, 183 002–1 183 001 között.16. kromoszóma16p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.30,2 Mb0,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 MbLUC7L: 188 943–229 485, fordított szálLUC7LFAM234A: 234 521–272 183, előre szálRGS11: 268 301–275 980, fordított szálRGS11ARHGDIG: 280 386–283 010, előre szálARHGDIGPDIA2: 283 152–287 215, előre szálPDIA2AXIN1: 287 440–352 734, fordított szálAXIN1MRPL28: 365 449–371 289, fordított szálMRPL28PGAP6: 370 779–387 113, fordított szálPGAP6NME4: 396 725–410 367, előre szálNME4DECR2: 401 834–412 492, előre szálDECR2RAB11FIP3: 425 593–523 012, előre szálRAB11FIP3CAPN15: 527 698–554 636, előre szálCAPN15PRR35: 559 688–565 532, előre szálPRR35PIGQ: 566 995–584 121, előre szálPIGQNHLRC4: 567 000–569 495, előre szálNHLRC4RAB40C: 589 007–629 348, előre szálRAB40CWFIKKN1: 629 239–634 117, előre szálMETTL26: 634 412–636 378, fordított szálMCRIP2: 636 817–648 475, előre szálWDR90: 649 287–667 837, előre szálRHOT2: 668 081–674 174, előre szálRHBDL1: 675 605–678 275, előre szálRHBDL1STUB1: 679 980–682 870, előre szálSTUB1JMJD8: 681 670–684 334, fordított szálJMJD8WDR24: 684 614–690 444, fordított szálWDR24FBXL16: 692 498–705 860, fordított szálMETRN: 715 093–719 796, előre szálANTKMT: 720 581–722 590, előre szálCCDC78: 722 581–726 954, fordított szálHAGHL: 726 494–735 525, előre szálCIAO3: 729 721–741 329, fordított szálMSLN: 760 729–768 866, előre szálMSLNMSLNL: 769 428–782 054, fordított szálMSLNLRPUSD1: 784 974–788 406, fordított szálRPUSD1CHTF18: 788 046–800 737, előre szálCHTF18GNG13: 798 020–800 770, fordított szálLMF1: 853 618–981 318, fordított szálLMF1SOX8: 981 444–986 979, előre szálSOX8SSTR5: 1 063 867–1 081 470, előre szálSSTR5C1QTNF8: 1 088 226–1 099 401, fordított szálC1QTNF8CACNA1H: 1 153 099–1 224 169, előre szálCACNA1HA JMJD8 ábrája: 9 exon a(z) 16. kromoszóma fordított szálán9. exon: 1 ismert betegségokozó hely9. exon: 681 670–682 874, 1205 bázis8. exon: 682 953–683 087, 135 bázis7. exon: 683 167–683 234, 68 bázis6. exon: 683 322–683 441, 120 bázis5. exon: 683 530–683 598, 69 bázis4. exon: 683 685–683 781, 97 bázis3. exon: 683 861–683 909, 49 bázis2. exon: 684 066–684 155, 90 bázis1. exon: 684 234–684 334, 101 bázis9876543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 2,7 kb-jából 1,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 795 bázis kódolja a fehérjét.

JMJD8 szekvenálása

5Alacsony

Mennyire nehéz a JMJD8 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések1,1%
  • GC-tartalom44%
  • Referencia-lefedettség0%

1

a JMJD8 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti

Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.

A teljes genom a JMJD8 gén mind a 2,7 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 1,9 kb-nyi exont.

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
  • Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). JMJD8 gén: jumonji domain containing 8. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/jmjd8

Vancouver

Dante Labs. JMJD8 gén: jumonji domain containing 8 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/jmjd8

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet