Gène
TNNI3
troponin I3, cardiac type
- HGNC 11947↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000129991↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 7137↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 19q13.42
- Coordonnées
- Chromosome 19 : 55 151 767–55 157 732 (GRCh38)
- Exons
- 8 exons sur 6 kb
- Protéine
- 210 acides aminés
- Aussi appelé
- TNNC1, CMH7, cTNI
- Symboles précédents
- CMD2A
- Transcrit MANE Select
- ENST00000344887.10NM_000363.5
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Obtenir mon Genome TestRapports d'expertise pertinents pour ce gène
Cardiomyopathie dilatée
Élargissement et affaiblissement du ventricule gauche non expliqués par une maladie coronarienne ou valvulaire ; les formes héréditaires impliquent TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN et de nombreux autres gènes, et comprennent le syndrome de Barth et les dystrophies musculaires d'Emery-Dreifuss.
- ClinGen juge le lien fort
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Connaître une cause génétique permet d'instaurer plus tôt une surveillance cardiaque et un dépistage familial. Pour les gènes à risque élevé d'arythmie, tels que LMNA, FLNC et RBM20, elle éclaire les décisions concernant la surveillance du rythme et les défibrillateurs implantables.
Cardiomyopathie restrictive
- Cardiomyopathie restrictive familiale 1 (TNNI3)Autosomique dominant
Forme de cardiomyopathie restrictive causée par des modifications du gène sarcomérique TNNI3.
- 1 évaluateur GenCC le classe comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Le fait de la connaître permet un suivi cardiaque spécialisé et un dépistage chez les apparentés.
Regroupements plus larges
Cardiomyopathie hypertrophique
- Autosomique dominant
L'un des 62 gènes qui lui sont liés
Une affection dans laquelle le myocarde est hypertrophié sans cause évidente. L'hypertrophie est généralement asymétrique et peut être associée à une obstruction de la chambre de chasse ventriculaire.
- ClinGen juge le lien définitif
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
- Dans la liste ACMG des résultats secondaires
▶Actionnabilité
Bêtabloquants, inhibiteurs calciques non-dihydropyridiniques, restriction d'activité physique, conseil génétique
Structure de TNNI3
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
- Variants avec une page
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 0,8 kb sur les 6 kb du gène ; 633 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de TNNI3
10Facile
Difficulté de séquençage de TNNI3 avec des lectures courtes, sur 100
0 · Facile100 · Difficile
Presque tous les exons de TNNI3 se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.
Facteur aggravant : la part des exons de TNNI3 située dans chaque type de région difficile
- MappabilitéPortions où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, si bien qu'un appel dans ces zones peut être manquant ou erroné. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 100.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 60.0 %
- Partagé avec le chrYLes régions pseudoautosomales et la région transposée du X, où les chrX et chrY portent la même séquence ou une séquence presque identique, si bien qu'une lecture issue de l'un peut être placée sur l'autre. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 60.0 %
- Couverture de la référenceLacunes dans l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 50.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et suites d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles peuvent ne pas couvrir en entier. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 30.0 %
- Teneur en GCFenêtres comportant moins de 25 % ou plus de 65 % de G et de C, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 20.50 %
Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du scoreChaque barre représente la part des bases exoniques de TNNI3 située dans ce type de région difficile. Chaque type peut à lui seul rendre un gène difficile, et chaque type supplémentaire ajoute moins : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans l'un d'eux, 100 lorsque toutes les bases se trouvent dans des zones où les lectures ne peuvent pas être placées de façon unique.
66
positions dans TNNI3 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se trouve dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome complet couvre les 6 kb de TNNI3 dans leur totalité, introns compris, et pas seulement les 0,8 kb d'exons.
Variants avec une page (18)
Les variants TNNI3 disposant d'une page ici, ceux avec le plus d'étoiles de révision en premier. Chaque page décrit le dossier public de ClinVar sur le variant, jamais un résultat.
| Variant | HGVS c. | Exon ou intron | Position (GRCh38) | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|---|---|
| R162Q | c.485G>A | Exon 7 | 55 154 094 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| R192C | c.574C>T | Exon 8 | 55 151 893 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| R192H | c.575G>A | Exon 8 | 55 151 892 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A2V | c.5C>T | Exon 1 | 55 157 585 | Probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| A157V | c.470C>T | Exon 7 | 55 154 109 | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| D196N | c.586G>A | Exon 8 | 55 151 881 | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| L198V | c.592C>G | Exon 8 | 55 151 875 | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| R69Afs*8 | c.204del | Exon 5 | 55 156 278 | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| R141Q | c.422G>A | Exon 7 | 55 154 157 | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| R145G | c.433C>G | Exon 7 | 55 154 146 | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
ClinVar pathogenic variants (78)
The TNNI3 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogène 30
- Pathogène/probablement pathogène 8
- Probablement pathogène 40
| Variant | Conditions | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|
| NM_000363.5(TNNI3):c.575G>A (p.Arg192His) | hypertrophic cardiomyopathy | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000363.5(TNNI3):c.574C>T (p.Arg192Cys) | hypertrophic cardiomyopathy | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000363.5(TNNI3):c.485G>A (p.Arg162Gln) | hypertrophic cardiomyopathy | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000363.5(TNNI3):c.557G>A (p.Arg186Gln) | cardiomyopathy and 3 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.509G>A (p.Arg170Gln) | hypertrophic cardiomyopathy and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.508C>T (p.Arg170Trp) | cardiomyopathy, familial restrictive, 1 and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.470C>T (p.Ala157Val) | cardiomyopathy and 3 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.433C>G (p.Arg145Gly) | cardiomyopathy and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.433C>T (p.Arg145Trp) | cardiomyopathy and 6 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.611G>A (p.Arg204His) | cardiomyopathy and 2 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.592C>G (p.Leu198Val) | cardiomyopathy and 2 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.586G>A (p.Asp196Asn) | cardiomyopathy and 6 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.497C>T (p.Ser166Phe) | cardiomyopathy and 2 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.485G>C (p.Arg162Pro) | familial hypertrophic cardiomyopathy and 2 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.434G>A (p.Arg145Gln) | cardiomyopathy and 5 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.422G>A (p.Arg141Gln) | cardiomyopathy and 6 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.204del (p.Arg69fs) | dilated cardiomyopathy and 4 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.407G>A (p.Arg136Gln) (opens in a new tab) | cardiomyopathy | Probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.5C>T (p.Ala2Val) | dilated cardiomyopathy 2A | Probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000363.5(TNNI3):c.610C>T (p.Arg204Cys) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 2 others | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000363.5(TNNI3):c.596G>A (p.Ser199Asn) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 2 others | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000363.5(TNNI3):c.549G>T (p.Lys183Asn) (opens in a new tab) | familial hypertrophic cardiomyopathy and 1 other | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000363.5(TNNI3):c.544G>A (p.Glu182Lys) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 3 others | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000363.5(TNNI3):c.529AAG[1] (p.Lys178del) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 1 other | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000363.5(TNNI3):c.532A>G (p.Lys178Glu) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial restrictive, 1 and 1 other | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
See all 78 with every other TNNI3 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gènes liés aux mêmes affections
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Partage 2 affections
- FLNCfilamin CPartage 2 affections
- JPH2junctophilin 2Partage 2 affections
- LDB3LIM domain binding 3Partage 2 affections
- MYBPC3myosin binding protein C3Partage 2 affections
- MYH7myosin heavy chain 7Partage 2 affections
- MYPNmyopalladinPartage 2 affections
- PLNphospholambanPartage 2 affections
- RAF1Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinasePartage 2 affections
- TCAPtitin-capPartage 2 affections
- TNNC1troponin C1, slow skeletal and cardiac typePartage 2 affections
- TNNT2troponin T2, cardiac typePartage 2 affections
Traits associés à TNNI3
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que TNNI3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the cardiovascular system
- Cardiac failure
- Enlarged and thickened heart muscle
- Increased left ventricular end-diastolic volume
- Stretched and thinned heart muscle
- Abnormal left ventricular function
- Left ventricular systolic dysfunction
- Severely reduced left ventricular ejection fraction
- Abnormal heart rate
Afficher 16 traits supplémentaires
- Apical hypertrophic cardiomyopathy
- Interstitial cardiac fibrosis
- Left atrial enlargement
- Left ventricular hypertrophy
- Pulmonary venous hypertension
- Right atrial enlargement
- Wolff-Parkinson-White syndrome
- Mitral regurgitation
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Supraventricular arrhythmia
- Tricuspid regurgitation
- Fainting spell
- Stroke
- Restrictive cardiomyopathy
- Sudden cardiac death
- Ventricular hypertrophy
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-19 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.19-9814e911.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène TNNI3 : troponin I3, cardiac type. Consulté le 20 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tnni3
Dante Labs. Gène TNNI3 : troponin I3, cardiac type [Internet]. [consulté le 20 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tnni3
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