Gen
TNNI3
troponin I3, cardiac type
- HGNC 11947↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000129991↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 7137↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 19q13.42
- Koordinatlar
- Kromozom 19: 55.151.767–55.157.732 (GRCh38)
- Eksonlar
- 6 kb boyunca 8 ekson
- Protein
- 210 amino asit
- Diğer adları
- TNNC1, CMH7, cTNI
- Önceki semboller
- CMD2A
- MANE Select transkripti
- ENST00000344887.10NM_000363.5
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tnni3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameTNNI3 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Dilate Kardiyomiyopati
Koroner arter veya kapak hastalığıyla açıklanamayan, sol ventrikülün genişleyip zayıflaması; kalıtsal formlar TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN ve diğer birçok genle ilişkilidir ve Barth sendromu ile Emery-Dreifuss kas distrofilerini içerir.
- ClinGen bu ilişkiyi güçlü olarak değerlendiriyor
- 3 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Genetik bir nedenin bilinmesi, kalp takibinin daha erken başlamasına ve aile taramasının yapılmasına destek olur. LMNA, FLNC ve RBM20 gibi yüksek aritmi riski taşıyan genler için ise ritim takibi ve implante edilebilir defibrilatör kararlarında yol gösterici olur.
Restriktif Kardiyomiyopati
- Ailesel Restriktif Kardiyomiyopati 1 (TNNI3)Otozomal dominant
Sarkomer geni TNNI3'teki değişikliklerden kaynaklanan bir restriktif kardiyomiyopati türü.
- 1 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Bu durumu bilmek, uzman kalp takibinin ve yakınlarda tarama yapılmasının sürdürülmesine destek olur.
Daha geniş gruplar
Hipertrofik Kardiyomiyopati
- Otozomal dominant
Buna bağlı 62 gen arasından biri
Miyokardın belirgin bir neden olmaksızın hipertrofiye uğradığı bir durum. Hipertrofi genellikle asimetriktir ve ventriküler çıkış yolu obstrüksiyonu ile ilişkili olabilir.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 3 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
- ACMG ikincil bulgular listesinde
▶Eyleme geçirilebilirlik
Beta-blokerler, dihidropiridin olmayan kalsiyum kanal blokerleri, aktivite kısıtlaması, genetik danışmanlık
TNNI3 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
- Sayfası olan varyantlar
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 6 kb uzunluğunun 0,8 kb'sini oluşturur; bu bazların 633 tanesi proteini kodlar.
TNNI3 dizilemesi
10Kolay
TNNI3 geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
TNNI3 geninin eksonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşlendiği yerlerde bulunuyor.
Buna ek olarak: TNNI3 geninin eksonlarının her zor bölge türündeki payı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölümler; bu nedenle burada yapılan bir tespit eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %100.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi, genomun başka yerlerindeki %90 veya daha yüksek benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %60.%0
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Ağırlık %60.%0
- Referans kapsamıYakındaki referans dizisindeki boşluklar; okumaların hizalanabileceği bir dizi bulunmayan yerler. Ağırlık %50.%0
- TekrarlarArdışık tekrarlar ve tek bazlı diziler; okumalar bunların üzerinde kayabilir ve tamamını kapsayamayabilir. Ağırlık %30.%0
- GC içeriğiYüzde 25'in altında ya da yüzde 65'in üzerinde G ve C içeren pencereler; kütüphane hazırlığı bunları zayıf kapsar. Ağırlık %20.%50
Dante Labs'in kendi araştırmasından elde edilen bir puan; NIST'in Genome in a Bottle haritaları, dizilemesi zor bölgeler üzerine kuruludur.Puanlama yöntemiHer çubuk, TNNI3 geninin ekson bazlarının o zor bölge türünde bulunan payını gösterir. Herhangi bir tür tek başına bir geni zor hale getirebilir; her ek tür ise daha az katkı yapar: hiçbir baz herhangi birinde yoksa 0, her baz okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgedeyse 100.
66
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı TNNI3 konumları
Bunlardan hiçbiri kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom dizilemesi, intronlar dahil TNNI3 geninin 6 kb'lık tamamını kapsar; yalnızca eksonların 0,8 kb'lık kısmını değil.
Sayfası olan varyantlar (18)
Burada sayfası bulunan TNNI3 varyantları, en çok inceleme yıldızına sahip olanlar önce gelecek şekilde listelenmiştir. Her sayfa, varyantla ilgili ClinVar'ın kamuya açık kaydını açıklar; hiçbir zaman bir sonuç değildir.
| Varyant | HGVS c. | Ekzon veya intron | Konum (GRCh38) | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|---|---|
| R162Q | c.485G>A | Ekzon 7 | 55.154.094 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| R192C | c.574C>T | Ekzon 8 | 55.151.893 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| R192H | c.575G>A | Ekzon 8 | 55.151.892 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| A2V | c.5C>T | Ekzon 1 | 55.157.585 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| A157V | c.470C>T | Ekzon 7 | 55.154.109 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| D196N | c.586G>A | Ekzon 8 | 55.151.881 | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| L198V | c.592C>G | Ekzon 8 | 55.151.875 | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| R69Afs*8 | c.204del | Ekzon 5 | 55.156.278 | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| R141Q | c.422G>A | Ekzon 7 | 55.154.157 | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| R145G | c.433C>G | Ekzon 7 | 55.154.146 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
ClinVar pathogenic variants (78)
The TNNI3 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patojenik 30
- Patojenik/muhtemelen patojenik 8
- Muhtemelen patojenik 40
| Varyant | Conditions | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|
| NM_000363.5(TNNI3):c.575G>A (p.Arg192His) | hypertrophic cardiomyopathy | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000363.5(TNNI3):c.574C>T (p.Arg192Cys) | hypertrophic cardiomyopathy | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000363.5(TNNI3):c.485G>A (p.Arg162Gln) | hypertrophic cardiomyopathy | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000363.5(TNNI3):c.557G>A (p.Arg186Gln) | cardiomyopathy and 3 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.509G>A (p.Arg170Gln) | hypertrophic cardiomyopathy and 2 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.508C>T (p.Arg170Trp) | cardiomyopathy, familial restrictive, 1 and 2 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.470C>T (p.Ala157Val) | cardiomyopathy and 3 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.433C>G (p.Arg145Gly) | cardiomyopathy and 2 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.433C>T (p.Arg145Trp) | cardiomyopathy and 6 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.611G>A (p.Arg204His) | cardiomyopathy and 2 others | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.592C>G (p.Leu198Val) | cardiomyopathy and 2 others | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.586G>A (p.Asp196Asn) | cardiomyopathy and 6 others | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.497C>T (p.Ser166Phe) | cardiomyopathy and 2 others | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.485G>C (p.Arg162Pro) | familial hypertrophic cardiomyopathy and 2 others | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.434G>A (p.Arg145Gln) | cardiomyopathy and 5 others | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.422G>A (p.Arg141Gln) | cardiomyopathy and 6 others | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.204del (p.Arg69fs) | dilated cardiomyopathy and 4 others | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.407G>A (p.Arg136Gln) (opens in a new tab) | cardiomyopathy | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.5C>T (p.Ala2Val) | dilated cardiomyopathy 2A | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_000363.5(TNNI3):c.610C>T (p.Arg204Cys) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 2 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_000363.5(TNNI3):c.596G>A (p.Ser199Asn) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 2 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_000363.5(TNNI3):c.549G>T (p.Lys183Asn) (opens in a new tab) | familial hypertrophic cardiomyopathy and 1 other | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_000363.5(TNNI3):c.544G>A (p.Glu182Lys) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 3 others | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_000363.5(TNNI3):c.529AAG[1] (p.Lys178del) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 1 other | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_000363.5(TNNI3):c.532A>G (p.Lys178Glu) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial restrictive, 1 and 1 other | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
See all 78 with every other TNNI3 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 12 durumu paylaşıyor
- FLNCfilamin C2 durumu paylaşıyor
- JPH2junctophilin 22 durumu paylaşıyor
- LDB3LIM domain binding 32 durumu paylaşıyor
- MYBPC3myosin binding protein C32 durumu paylaşıyor
- MYH7myosin heavy chain 72 durumu paylaşıyor
- MYPNmyopalladin2 durumu paylaşıyor
- PLNphospholamban2 durumu paylaşıyor
- RAF1Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase2 durumu paylaşıyor
- TCAPtitin-cap2 durumu paylaşıyor
- TNNC1troponin C1, slow skeletal and cardiac type2 durumu paylaşıyor
- TNNT2troponin T2, cardiac type2 durumu paylaşıyor
TNNI3 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, TNNI3 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the cardiovascular system
- Cardiac failure
- Enlarged and thickened heart muscle
- Increased left ventricular end-diastolic volume
- Stretched and thinned heart muscle
- Abnormal left ventricular function
- Left ventricular systolic dysfunction
- Severely reduced left ventricular ejection fraction
- Abnormal heart rate
16 özellik daha göster
- Apical hypertrophic cardiomyopathy
- Interstitial cardiac fibrosis
- Left atrial enlargement
- Left ventricular hypertrophy
- Pulmonary venous hypertension
- Right atrial enlargement
- Wolff-Parkinson-White syndrome
- Mitral regurgitation
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Supraventricular arrhythmia
- Tricuspid regurgitation
- Fainting spell
- Stroke
- Restrictive cardiomyopathy
- Sudden cardiac death
- Ventricular hypertrophy
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-19 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.19-9814e911.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). TNNI3 geni: troponin I3, cardiac type. Erişim tarihi: 19 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/tnni3
Dante Labs. TNNI3 geni: troponin I3, cardiac type [Internet]. [alıntı tarihi 19 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/tnni3
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde