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Gène

TFE3

transcription factor binding to IGHM enhancer 3

Résumé

Localisation cytogénétique
Xp11.23
Coordonnées
Chromosome X : 49 028 726–49 043 357 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 14,6 kb
Protéine
575 acides aminés
Aussi appelé
TFEA, bHLHe33
Transcrit MANE Select
ENST00000315869.8NM_006521.6
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    Structure de TFE3

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome X, avec un crochet à l'emplacement de TFE3. TFE3 et 38 gènes à proximité sur le chromosome X, de 48 536 042 à 49 536 041.Chromosome XXp11.23p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2848,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 Mb49,4 Mb : 48 521 806–48 545 469, brin directTBC1D25 : 48 539 623–48 562 613, brin directTBC1D25RBM3 : 48 574 056–48 581 162, brin directRBM3WDR13 : 48 589 838–48 608 869, brin directWDR13WAS : 48 676 593–48 691 431, brin directWASSUV39H1 : 48 695 554–48 709 556, brin directSUV39H1GLOD5 : 48 761 744–48 773 648, brin directGLOD5GATA1 : 48 783 122–48 794 311, brin directGATA1HDAC6 : 48 801 372–48 824 986, brin directHDAC6ERAS : 48 826 513–48 830 138, brin directERASPCSK1N : 48 831 088–48 835 632, brin inversePCSK1NTIMM17B : 48 880 274–48 898 143, brin inversePQBP1 : 48 890 197–48 903 640, brin directPQBP1SLC35A2 : 48 903 180–48 911 958, brin inverseSLC35A2PIM2 : 48 913 172–48 919 546, brin inversePIM2OTUD5 : 48 922 024–48 958 390, brin inverseOTUD5KCND1 : 48 960 982–48 971 916, brin inverseKCND1GRIPAP1 : 48 973 719–49 002 265, brin inverseGRIPAP1TFE3 : 49 028 726–49 043 357, brin inverseTFE3CCDC120 : 49 053 463–49 073 357, brin directCCDC120PRAF2 : 49 070 107–49 074 022, brin inversePRAF2 : 49 071 470–49 079 887, brin inverseWDR45 : 49 074 431–49 101 203, brin inverseWDR45GPKOW : 49 112 941–49 123 750, brin inverseGPKOWMAGIX : 49 162 564–49 169 931, brin directMAGIXPLP2 : 49 171 787–49 175 387, brin directPLP2PRICKLE3 : 49 174 802–49 186 528, brin inversePRICKLE3SYP : 49 187 807–49 200 218, brin inverseSYPCACNA1F : 49 205 063–49 233 371, brin inverseCCDC22 : 49 235 444–49 250 526, brin directCCDC22FOXP3 : 49 250 436–49 264 800, brin inverseFOXP3 : 49 258 343–49 270 477, brin inversePPP1R3F : 49 269 771–49 301 468, brin directPPP1R3FGAGE10 : 49 303 645–49 319 844, brin directGAGE10GAGE12J : 49 322 037–49 329 387, brin directGAGE12JGAGE13 : 49 331 575–49 338 952, brin directGAGE13GAGE2E : 49 341 192–49 345 922, brin directGAGE12B : 49 529 869–49 529 985, brin directGAGE12BGAGE12C : 49 532 177–49 539 541, brin directGAGE12CSchéma de TFE3 : 10 exons sur le brin inverse du chromosome XExon 4 : 8 sites connus associés à une maladieExon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 10 : 49 028 726–49 030 601, 1 876 basesExon 9 : 49 031 397–49 031 544, 148 basesExon 8 : 49 033 465–49 033 540, 76 basesExon 7 : 49 033 726–49 033 782, 57 basesExon 6 : 49 034 134–49 034 251, 118 basesExon 5 : 49 038 010–49 038 114, 105 basesExon 4 : 49 038 197–49 038 442, 246 basesExon 3 : 49 039 107–49 039 410, 304 basesExon 2 : 49 040 455–49 040 568, 114 basesExon 1 : 49 043 111–49 043 357, 247 bases109876543215′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 3,3 kb sur les 14,6 kb du gène ; 1 728 de ces bases codent pour la protéine.

    Séquençage de TFE3

    10

    positions de TFE3 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

    Un génome entier couvre les 14,6 kb de TFE3, introns compris, et pas seulement les 3,3 kb d'exons.

    Gènes liés aux mêmes affections

    Traits associés à TFE3

    L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que TFE3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

    Liens externes

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-17 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène TFE3 : transcription factor binding to IGHM enhancer 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tfe3

    Vancouver

    Dante Labs. Gène TFE3 : transcription factor binding to IGHM enhancer 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tfe3

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