Aller au contenu
Utilisez vos fonds HSA ou FSA

Gène

LETM1

leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1

Résumé

Localisation cytogénétique
4p16.3
Coordonnées
Chromosome 4 : 1 811 479–1 856 156 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 44,7 kb
Protéine
739 acides aminés
Aussi appelé
SLC55A1, Mdm38
Transcrit MANE Select
ENST00000302787.3NM_012318.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore LETM1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de LETM1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 4, avec un crochet à l'emplacement de LETM1. LETM1 et 17 gènes à proximité sur le chromosome 4, de 1 333 818 à 2 333 817.Chromosome 44p16.3p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.21,4 Mb1,6 Mb1,8 Mb2 Mb2,2 MbMAEA : 1 289 839–1 340 148, brin directMAEAUVSSA : 1 345 691–1 395 989, brin directUVSSANKX1-1 : 1 402 932–1 406 442, brin inverseNKX1-1FAM53A : 1 617 915–1 684 356, brin inverseFAM53ASLBP : 1 692 731–1 712 344, brin inverseSLBPTACC3 : 1 712 858–1 745 178, brin directTACC3TMEM129 : 1 715 951–1 721 367, brin inverseTMEM129FGFR3 : 1 793 286–1 808 873, brin directFGFR3LETM1 : 1 811 479–1 856 156, brin inverseLETM1NSD2 : 1 870 559–1 982 207, brin directNSD2NELFA : 1 982 715–2 041 903, brin inverseNELFANICOL1 : 2 040 628–2 043 964, brin directNICOL1ASPNAT : 2 058 662–2 069 089, brin directASPNATPOLN : 2 071 918–2 242 138, brin inversePOLN : 2 078 998–2 242 276, brin inverseHAUS3 : 2 227 462–2 242 190, brin inverseHAUS3MXD4 : 2 247 431–2 262 144, brin inverseMXD4ZFYVE28 : 2 269 578–2 418 794, brin inverseZFYVE28Schéma de LETM1 : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 4Exon 12 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 14 : 1 811 479–1 814 573, 3 095 basesExon 13 : 1 815 664–1 815 802, 139 basesExon 12 : 1 816 727–1 816 914, 188 basesExon 11 : 1 819 338–1 819 472, 135 basesExon 10 : 1 822 181–1 822 312, 132 basesExon 9 : 1 822 988–1 823 131, 144 basesExon 8 : 1 823 644–1 823 775, 132 basesExon 7 : 1 825 564–1 825 683, 120 basesExon 6 : 1 832 744–1 832 947, 204 basesExon 5 : 1 834 845–1 834 982, 138 basesExon 4 : 1 836 429–1 836 572, 144 basesExon 3 : 1 841 347–1 841 797, 451 basesExon 2 : 1 849 149–1 849 209, 61 basesExon 1 : 1 855 869–1 856 156, 288 bases141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,4 kb sur les 44,7 kb du gène ; 2 220 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit LETM1

3

positions dans LETM1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 44,7 kb de LETM1, introns compris, et pas seulement les 5,4 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène LETM1 : leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/letm1

Vancouver

Dante Labs. Gène LETM1 : leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/letm1

Un seul test. Des réponses pour toute la vie.

À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines

Obtenir mon Genome Test