Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

LETM1

leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
4p16.3
Koordinaadid
Kromosoom 4: 1 811 479–1 856 156 (GRCh38)
Eksonid
14 eksonit, ulatus 44,7 kb
Valk
739 aminohapet
Tuntud ka kui
SLC55A1, Mdm38
MANE Select transkript
ENST00000302787.3NM_012318.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni LETM1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas LETM1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 4, millel on sulg kohal, kus asub LETM1. LETM1 ja sellele lähedal asuvad 17 geeni kromosoomil 4, vahemikus 1 333 818 kuni 2 333 817.Kromosoom 44p16.3p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.21,4 Mb1,6 Mb1,8 Mb2 Mb2,2 MbMAEA: 1 289 839–1 340 148, otsene ahelMAEAUVSSA: 1 345 691–1 395 989, otsene ahelUVSSANKX1-1: 1 402 932–1 406 442, pöördne ahelNKX1-1FAM53A: 1 617 915–1 684 356, pöördne ahelFAM53ASLBP: 1 692 731–1 712 344, pöördne ahelSLBPTACC3: 1 712 858–1 745 178, otsene ahelTACC3TMEM129: 1 715 951–1 721 367, pöördne ahelTMEM129FGFR3: 1 793 286–1 808 873, otsene ahelFGFR3LETM1: 1 811 479–1 856 156, pöördne ahelLETM1NSD2: 1 870 559–1 982 207, otsene ahelNSD2NELFA: 1 982 715–2 041 903, pöördne ahelNELFANICOL1: 2 040 628–2 043 964, otsene ahelNICOL1ASPNAT: 2 058 662–2 069 089, otsene ahelASPNATPOLN: 2 071 918–2 242 138, pöördne ahelPOLN: 2 078 998–2 242 276, pöördne ahelHAUS3: 2 227 462–2 242 190, pöördne ahelHAUS3MXD4: 2 247 431–2 262 144, pöördne ahelMXD4ZFYVE28: 2 269 578–2 418 794, pöördne ahelZFYVE28LETM1 skeem: 14 eksonit kromosoomi 4 pöördne ahelalEkson 12: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 6: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 14: 1 811 479–1 814 573, 3095 alustEkson 13: 1 815 664–1 815 802, 139 alustEkson 12: 1 816 727–1 816 914, 188 alustEkson 11: 1 819 338–1 819 472, 135 alustEkson 10: 1 822 181–1 822 312, 132 alustEkson 9: 1 822 988–1 823 131, 144 alustEkson 8: 1 823 644–1 823 775, 132 alustEkson 7: 1 825 564–1 825 683, 120 alustEkson 6: 1 832 744–1 832 947, 204 alustEkson 5: 1 834 845–1 834 982, 138 alustEkson 4: 1 836 429–1 836 572, 144 alustEkson 3: 1 841 347–1 841 797, 451 alustEkson 2: 1 849 149–1 849 209, 61 alustEkson 1: 1 855 869–1 856 156, 288 alust141210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 5,4 kb kogupikkusega 44,7 kb; neist 2220 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse LETM1

3

kohad geenis LETM1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni LETM1 44,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (5,4 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). LETM1 geen: leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/letm1

Vancouver

Dante Labs. LETM1 geen: leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/letm1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test