Geeni
PKHD1
PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin
- HGNC 9016↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000170927↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5314↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 6p12.3-p12.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 6: 51 615 299–52 087 613 (GRCh38)
- Eksonit
- 67 eksonia 472,3 kb:n alueella
- Proteiini
- 4 074 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- ARPKD, FCYT, FPC
- Aiemmat symbolit
- TIGM1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000371117.8NM_138694.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PKHD1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Polykystinen munuaissairaus
Yleensä autosomaalisesti dominanttisesti, harvemmin autosomaalisesti resessiivisesti periytyvä perinnöllinen sairaus, jolle on tyypillistä munuaisten lukuisat kystat. Ne voivat johtaa loppuvaiheen munuaisten vajaatoimintaan. Autosomaalisesti dominantti muoto liittyy kromosomin 16 lyhyen haaran poikkeavuuteen. Autosomaalisesti dominanttia muotoa sairastavilla oireet ilmaantuvat yleensä keski-iässä, ja niitä ovat vatsakipu, virtsan veriset eritteet ja korkea verenpaine. Potilailla voi kehittyä aivovaltimoaneurysmoja ja maksakystia. Autosomaalisesti resessiivistä muotoa sairastavilla ilmenee jo varhain etenevä munuaisten vajaatoiminta sekä maksan fibroosista johtuvia oireita. Autosomaalisesti resessiivinen muoto liittyy kromosomin 6 poikkeavuuksiin. Polykystinen munuaissairaus voi myös kehittyä sivuvaikutuksena potilailla, joita dialysoidaan.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 7 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tolvaptaani (Jynarque, FDA 2018) nopeasti etenevän ADPKD:n hoitoon; verenpaineen hoito (tavoite alle 110/75); kivunhoito; kystainfektion hoito; aivojen MRA-seulonta kallonsisäisten aneurysmien varalta; munuaissiirto loppuvaiheen munuaisten vajaatoiminnan hoitoon
PKHD1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 16,3 kb geenin 472,3 kb:stä; 12 225 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PKHD1
1 481
PKHD1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 472,3 kb geenistä PKHD1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 16,3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ALG5ALG5 dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- DNAJB11DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B11Yhteinen sairaus: 1
- DZIP1LDAZ interacting zinc finger protein 1 likeYhteinen sairaus: 1
- GANABglucosidase II alpha subunitYhteinen sairaus: 1
- IFT140intraflagellar transport 140Yhteinen sairaus: 1
- NEK8NIMA related kinase 8Yhteinen sairaus: 1
- PKD1polycystin 1, transient receptor potential channel interactingYhteinen sairaus: 1
- PKD2polycystin 2, transient receptor potential cation channelYhteinen sairaus: 1
Geeniin PKHD1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PKHD1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the digestive system
- Hepatic fibrosis
- Periportal fibrosis
- Slowed or blocked flow of bile from liver
- Abdominal pain
- Abnormal intrahepatic bile duct morphology
- Bile duct inflammation
- Biliary hyperplasia
- Enlarged vein in esophagus
Näytä 20 piirrettä lisää
- Excessive buildup of connective tissue and scarring of liver at birth
- Fat malabsorption
- Feeding difficulties
- Impaired release of bile from liver
- Jaundice
- Abdominal rigidity
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Anorexia
- Enlarged liver
- Gallstones
- Hepatoblastoma
- Nausea
- Protein-losing enteropathy
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Vomiting
- Bile duct cancer
- Biliary cirrhosis
- Liver abscess
- Pancreatic cysts
- Liver cysts
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PKHD1-geeni: PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pkhd1
Dante Labs. PKHD1-geeni: PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pkhd1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa