Gén
PKHD1
PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin
- HGNC 9016↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000170927↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 5314↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 6p12.3-p12.2
- Koordináták
- 6. kromoszóma: 51 615 299–52 087 613 (GRCh38)
- Exonok
- 67 exon, összesen 472,3 kb
- Fehérje
- 4074 aminosav
- Más néven ismert
- ARPKD, FCYT, FPC
- Korábbi jelölések
- TIGM1
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000371117.8NM_138694.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pkhd1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a PKHD1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Polycystic Kidney Disease
A usually autosomal dominant and less frequently autosomal recessive genetic disorder characterized by the presence of numerous cysts in the kidneys leading to end-stage renal failure. The autosomal dominant trait is associated with abnormalities on the short arm of chromosome 16. Symptoms in patients with the autosomal dominant trait usually appear at middle age and include abdominal pain, hematuria, and high blood pressure. Patients may develop brain aneurysms and liver cysts. Patients with the autosomal recessive trait present with progressive renal failure early in life and symptoms resulting from hepatic fibrosis. The autosomal recessive trait is associated with abnormalities of chromosome 6. Polycystic kidney disease may also result as a side effect in patients on renal dialysis.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 7 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Beavatkozhatóság
Tolvaptan (Jynarque, FDA 2018) for rapidly progressive ADPKD; blood pressure control (target <110/75); pain management; cyst infection treatment; brain MRA screening for intracranial aneurysms; kidney transplantation for ESRD
A PKHD1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 472,3 kb-jából 16,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 12 225 bázis kódolja a fehérjét.
PKHD1 szekvenálása
1481
PKHD1-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem olyan régióba esik, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
A teljes genomszekvenálás a PKHD1 gén mind a 472,3 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 16,3 kb-át.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ALG5ALG5 dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase1 betegséget oszt meg
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferase1 betegséget oszt meg
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase1 betegséget oszt meg
- DNAJB11DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B111 betegséget oszt meg
- DZIP1LDAZ interacting zinc finger protein 1 like1 betegséget oszt meg
- GANABglucosidase II alpha subunit1 betegséget oszt meg
- IFT140intraflagellar transport 1401 betegséget oszt meg
- NEK8NIMA related kinase 81 betegséget oszt meg
- PKD1polycystin 1, transient receptor potential channel interacting1 betegséget oszt meg
- PKD2polycystin 2, transient receptor potential cation channel1 betegséget oszt meg
A(z) PKHD1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PKHD1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the digestive system
- Hepatic fibrosis
- Periportal fibrosis
- Slowed or blocked flow of bile from liver
- Abdominal pain
- Abnormal intrahepatic bile duct morphology
- Bile duct inflammation
- Biliary hyperplasia
- Enlarged vein in esophagus
Még 20 tulajdonság megjelenítése
- Excessive buildup of connective tissue and scarring of liver at birth
- Fat malabsorption
- Feeding difficulties
- Impaired release of bile from liver
- Jaundice
- Abdominal rigidity
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Anorexia
- Enlarged liver
- Gallstones
- Hepatoblastoma
- Nausea
- Protein-losing enteropathy
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Vomiting
- Bile duct cancer
- Biliary cirrhosis
- Liver abscess
- Pancreatic cysts
- Liver cysts
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PKHD1 gén: PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pkhd1
Dante Labs. PKHD1 gén: PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pkhd1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt