Geeni
GATA2
GATA binding protein 2
- HGNC 4171↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000179348↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 2624↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 3q21.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 3: 128 479 427–128 493 201 (GRCh38)
- Eksonit
- 6 eksonia 13,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 480 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- NFE1B
- MANE Select -transkripti
- ENST00000341105.7NM_032638.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue GATA2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Perinnöllinen alttius myeloisiin verisyöpiin
- GATA2-puutos, jolla on taipumus myelodysplastiseen oireyhtymään/AML:äänAutosomaalinen dominantti
GATA2-variantit, jotka aiheuttavat matalia monosyyttien, B-solujen ja NK-solujen määriä, infektioita, lymfedeemaa ja suurta riskiä sairastua myelodysplastiseen oireyhtymään ja leukemiaan.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Verenkuvan ja luuytimen seuranta, infektioiden ehkäisy sekä varhainen harkinta kantasolusiirron tarpeesta.
Laajemmat ryhmät
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Immuunipuutossairaus
Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä
Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
GATA2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,4 kb geenin 13,8 kb:stä; 1 443 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä GATA2
170
GATA2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 13,8 kb geenistä GATA2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,4 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ADAadenosine deaminaseYhteinen sairaus: 1
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseYhteinen sairaus: 1
- AK2adenylate kinase 2Yhteinen sairaus: 1
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BYhteinen sairaus: 1
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Yhteinen sairaus: 1
- ATMATM serine/threonine kinaseYhteinen sairaus: 1
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Yhteinen sairaus: 1
- B2Mbeta-2-microglobulinYhteinen sairaus: 1
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Yhteinen sairaus: 1
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorYhteinen sairaus: 1
- BCL11BBCL11 transcription factor BYhteinen sairaus: 1
- BLNKB cell linkerYhteinen sairaus: 1
Geeniin GATA2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita GATA2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Low B cell count
- Low blood monocyte number
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Megakaryocyte nucleus hypolobulation
- Myelodysplasia
- Reduced total natural killer cell count
- Abnormal total neutrophil count
Näytä 16 piirrettä lisää
- Acute blood cancer
- Bone marrow failure
- Low platelet count
- Prolonged bleeding time
- Acute myeloid leukemia
- Bleeding within the skull
- Bruising susceptibility
- Hypercoagulability
- Aplastic anemia
- Elevated white blood count
- Inverted CD4:CD8 ratio
- Myeloproliferative disorder
- Blood cancer
- Decreased blood lymphocyte number
- Low blood cell count
- Myeloid leukemia
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). GATA2-geeni: GATA binding protein 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/gata2
Dante Labs. GATA2-geeni: GATA binding protein 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/gata2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa