Gen
GATA2
GATA binding protein 2
- HGNC 4171↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000179348↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 2624↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 3q21.3
- Coördinaten
- Chromosoom 3: 128.479.427–128.493.201 (GRCh38)
- Exons
- 6 exons over 13,8 kb
- Eiwit
- 480 aminozuren
- Ook bekend als
- NFE1B
- MANE Select-transcript
- ENST00000341105.7NM_032638.5
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gata2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees GATA2 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Erfelijke aanleg voor myeloïde bloedkanker
- GATA2-deficiëntie met gevoeligheid voor MDS/AMLAutosomaal dominant
GATA2-varianten die leiden tot lage aantallen monocyten, B-cellen en NK-cellen, infecties, lymfoedeem en een hoog risico op myelodysplastisch syndroom en leukemie.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Controle van het bloedbeeld en het beenmerg, preventie van infecties, en vroege overweging van een stamceltransplantatie.
Bredere groeperingen
Overige aangeboren immuunstoornissen
- Immuundeficiëntieziekte
Een van 170 genen die hiermee verband houden
Ziekte waarbij er een tekort of defect is in de mechanismen van de immuniteit, zowel cellulair als humoraal.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
HSCT bij SCID en ernstige PID's; immunoglobulinevervangende therapie (IVIG/SCIG) bij antilichaamdeficiënties; leniolisib (Joenja, FDA 2023) bij APDS; genetherapie bij ADA-SCID; abatacept bij CTLA4- of LRBA-deficiëntie; profylactische antibiotica; G-CSF bij CGD
Opbouw van GATA2
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,4 kb van de 13,8 kb van het gen; 1.443 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van GATA2
170
posities in GATA2 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 13,8 kb van GATA2, inclusief intronen, en niet alleen de 3,4 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ADAadenosine deaminaseDeelt 1 aandoening
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeelt 1 aandoening
- AK2adenylate kinase 2Deelt 1 aandoening
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BDeelt 1 aandoening
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Deelt 1 aandoening
- ATMATM serine/threonine kinaseDeelt 1 aandoening
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deelt 1 aandoening
- B2Mbeta-2-microglobulinDeelt 1 aandoening
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Deelt 1 aandoening
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDeelt 1 aandoening
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeelt 1 aandoening
- BLNKB cell linkerDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan GATA2
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die GATA2 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Low B cell count
- Low blood monocyte number
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Megakaryocyte nucleus hypolobulation
- Myelodysplasia
- Reduced total natural killer cell count
- Abnormal total neutrophil count
Toon 16 kenmerken meer
- Acute blood cancer
- Bone marrow failure
- Low platelet count
- Prolonged bleeding time
- Acute myeloid leukemia
- Bleeding within the skull
- Bruising susceptibility
- Hypercoagulability
- Aplastic anemia
- Elevated white blood count
- Inverted CD4:CD8 ratio
- Myeloproliferative disorder
- Blood cancer
- Decreased blood lymphocyte number
- Low blood cell count
- Myeloid leukemia
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). GATA2-gen: GATA binding protein 2. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/gata2
Dante Labs. GATA2-gen: GATA binding protein 2 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/gata2
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken