Geeni
CIROP
ciliated left-right organizer metallopeptidase
- HGNC 53647↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000283654↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 100128908↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 14q11.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 14: 23 099 062–23 104 989 (GRCh38)
- Eksonit
- 16 eksonia 5,9 kb:n alueella
- Proteiini
- 788 aminohappoa
- Aiemmat symbolit
- LMLN2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000637218.2NM_001354640.2
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cirop.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue CIROP ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Heterotaksia ja lateralisaatiohäiriöt
- Viskeraalinen heterotaksia
Sisäelinten epänormaali vasen–oikea-asettelu, joka aiheutuu geenien, kuten ZIC3 (X-kromosomiin kytkeytyvä), NODAL, CFC1, MMP21 ja PKD1L1, muutoksista. Siihen liittyy usein monimutkaisia sydänvirheitä ja pernan poikkeavuuksia.
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tiedosta on hyötyä sydämen ja vatsaontelon kuvantamisessa, infektioiden ehkäisyssä, jos perna puuttuu, sekä lisääntymiseen liittyvässä neuvonnassa.
CIROP-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,7 kb geenin 5,9 kb:stä; 2 367 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: CIROP
5
CIROP-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 5,9 kb geenistä CIROP, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 2,7 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ACVR2Bactivin A receptor type 2BYhteinen sairaus: 1
- CFAP53cilia and flagella associated protein 53Yhteinen sairaus: 1
- CFC1cryptic, EGF-CFC family member 1Yhteinen sairaus: 1
- DAW1dynein assembly factor with WD repeats 1Yhteinen sairaus: 1
- GDF1growth differentiation factor 1Yhteinen sairaus: 1
- MMP21matrix metallopeptidase 21Yhteinen sairaus: 1
- MNS1meiosis specific nuclear structural 1Yhteinen sairaus: 1
- NODALnodal growth differentiation factorYhteinen sairaus: 1
- PKD1L1polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interactingYhteinen sairaus: 1
- ZIC3Zic family zinc finger 3Yhteinen sairaus: 1
Geeniin CIROP liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CIROP voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the cardiovascular system
- All organs on wrong side of body
- Complete atrioventricular canal defect
- Double outlet right ventricle
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Common atrium
- Discordant atrioventricular connection
- Heart tip and four chambers point towards right side of body
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
Näytä 16 piirrettä lisää
- Left superior vena cava draining to coronary sinus
- Levotransposition of the great arteries
- Narrowing of pulmonic valve
- Patent ductus arteriosus
- Patent foramen ovale
- Pulmonary artery atresia
- Single ventricle
- Underdeveloped aortic arch
- Dextrotransposition of the great arteries
- Double aortic arch
- Double inlet right ventricle
- Narrowing of aorta
- Partial anomalous pulmonary venous return
- Right aortic arch
- Single coronary artery origin
- Underdeveloped left heart
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). CIROP-geeni: ciliated left-right organizer metallopeptidase. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cirop
Dante Labs. CIROP-geeni: ciliated left-right organizer metallopeptidase [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cirop
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa