Gen
CIROP
ciliated left-right organizer metallopeptidase
- HGNC 53647↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000283654↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 100128908↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 14q11.2
- Koordinater
- Kromosom 14: 23 099 062–23 104 989 (GRCh38)
- Exoner
- 16 exoner på 5,9 kb
- Protein
- 788 aminosyror
- Tidigare symboler
- LMLN2
- MANE Select-transkript
- ENST00000637218.2NM_001354640.2
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs CIROP, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Heterotaxi och lateralitetsdefekter
- Viscerell heterotaxi
Avvikande vänster-höger-placering av de inre organen, orsakad av förändringar i gener som ZIC3 (X-kromosomal), NODAL, CFC1, MMP21 och PKD1L1, ofta med komplexa hjärtfel och avvikelser i mjälten.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Om du känner till detta kan det underlätta hjärt- och bukundersökningar, infektionsskydd om mjälten saknas, och genetisk rådgivning kring familjeplanering.
Så är CIROP uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,7 kb av genens 5,9 kb, och 2 367 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest CIROP
5
positioner i CIROP där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 5,9 kb av CIROP, med introner inräknade, inte bara de 2,7 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ACVR2Bactivin A receptor type 2BDelar 1 tillstånd
- CFAP53cilia and flagella associated protein 53Delar 1 tillstånd
- CFC1cryptic, EGF-CFC family member 1Delar 1 tillstånd
- DAW1dynein assembly factor with WD repeats 1Delar 1 tillstånd
- GDF1growth differentiation factor 1Delar 1 tillstånd
- MMP21matrix metallopeptidase 21Delar 1 tillstånd
- MNS1meiosis specific nuclear structural 1Delar 1 tillstånd
- NODALnodal growth differentiation factorDelar 1 tillstånd
- PKD1L1polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interactingDelar 1 tillstånd
- ZIC3Zic family zinc finger 3Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till CIROP
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CIROP kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the cardiovascular system
- All organs on wrong side of body
- Complete atrioventricular canal defect
- Double outlet right ventricle
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Common atrium
- Discordant atrioventricular connection
- Heart tip and four chambers point towards right side of body
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
Visa ytterligare 16 egenskaper
- Left superior vena cava draining to coronary sinus
- Levotransposition of the great arteries
- Narrowing of pulmonic valve
- Patent ductus arteriosus
- Patent foramen ovale
- Pulmonary artery atresia
- Single ventricle
- Underdeveloped aortic arch
- Dextrotransposition of the great arteries
- Double aortic arch
- Double inlet right ventricle
- Narrowing of aorta
- Partial anomalous pulmonary venous return
- Right aortic arch
- Single coronary artery origin
- Underdeveloped left heart
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CIROP-genen: ciliated left-right organizer metallopeptidase. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/cirop
Dante Labs. CIROP-genen: ciliated left-right organizer metallopeptidase [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/cirop
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor