Geen
CPLANE1
ciliogenesis and planar polarity effector complex subunit 1
- HGNC 25801↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000197603↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 65250↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 5p13.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 5: 37 106 235–37 249 376 (GRCh38)
- Eksonid
- 53 eksonit, ulatus 143,1 kb
- Valk
- 3251 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FLJ13231, JBTS17, Hug
- Varasemad tähised
- C5orf42
- MANE Select transkript
- ENST00000651892.2NM_001384732.1
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe CPLANE1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Joubertův syndrom a související poruchy
- Joubert'i sündroom
Tsiliopaatia, mida iseloomustab ajutüve ja väikeaju väärareng (hambakujuline märk ehk molaarhamba märk), madal lihastoonus, arengu viivitus ning ebanormaalsed silmaliigutused; mõnikord kaasneb neerude, maksa või silmade kaasatus.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas CPLANE1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 11,3 kb kogupikkusega 143,1 kb; neist 9756 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CPLANE1
177
kohad geenis CPLANE1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CPLANE1 143,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (11,3 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- AHI1Abelson helper integration site 1Jagab 1 haigust
- ARL13BARF like GTPase 13BJagab 1 haigust
- ARL3ARF like GTPase 3Jagab 1 haigust
- ARMC9armadillo repeat containing 9Jagab 1 haigust
- B9D1B9 domain containing 1Jagab 1 haigust
- B9D2B9 domain containing 2Jagab 1 haigust
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AJagab 1 haigust
- CEP104centrosomal protein 104Jagab 1 haigust
- CEP120centrosomal protein 120Jagab 1 haigust
- CEP290centrosomal protein 290Jagab 1 haigust
- CEP41centrosomal protein 41Jagab 1 haigust
- CSPP1centrosome and spindle pole associated protein 1Jagab 1 haigust
Geeniga CPLANE1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CPLANE1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Molar tooth sign on MRI
- Ataxia
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Intellectual disability
- Abnormal gait
- Abnormality of peripheral nerve conduction
- Degeneration of anterior horn cells
Näita veel 16 tunnust
- Hypoplasia of olfactory tract
- Hypothalamic hamartoma
- Abnormality of movement
- Abnormality of neuronal migration
- Agenesis of corpus callosum
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- Epilepsy
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- More grooves in brain
- Muscle twitch
- Occipital meningocele
- Periventricular nodular heterotopia
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Tremor
Abnormality of limbs
- Preaxial foot polydactyly
- Abnormality of the upper limb
- Distal upper limb amyotrophy
- Curvature of finger
- Extra little finger
- Fused toes
- Mesoaxial hand polydactyly
- Preaxial polydactyly
Näita veel 14 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CPLANE1 geen: ciliogenesis and planar polarity effector complex subunit 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cplane1
Dante Labs. CPLANE1 geen: ciliogenesis and planar polarity effector complex subunit 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cplane1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast