Gen
CPLANE1
ciliogenesis and planar polarity effector complex subunit 1
- HGNC 25801↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000197603↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 65250↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 5p13.2
- Koordinater
- Kromosom 5: 37.106.235–37.249.376 (GRCh38)
- Exoner
- 53 exoner fordelt over 143,1 kb
- Protein
- 3.251 aminosyrer
- Også kendt som
- FLJ13231, JBTS17, Hug
- Tidligere symboler
- C5orf42
- MANE Select-transkript
- ENST00000651892.2NM_001384732.1
- Lokustype
- gene with protein product
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs CPLANE1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Joubert-syndrom og beslægtede lidelser
- Joubert-syndrom
En ciliopati, der kendetegnes ved en misdannelse af lillehjernen og hjernestammen (det såkaldte molartand-tegn), med nedsat muskelspænding, forsinket udvikling og unormale øjenbevægelser. Nogle gange ses også involvering af nyrerne, leveren eller øjnene.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er CPLANE1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 11,3 kb af genets 143,1 kb; 9.756 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest CPLANE1
177
positioner i CPLANE1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 143,1 kb af CPLANE1, inklusive introner, og ikke kun de 11,3 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- AHI1Abelson helper integration site 1Deler 1 sygdom
- ARL13BARF like GTPase 13BDeler 1 sygdom
- ARL3ARF like GTPase 3Deler 1 sygdom
- ARMC9armadillo repeat containing 9Deler 1 sygdom
- B9D1B9 domain containing 1Deler 1 sygdom
- B9D2B9 domain containing 2Deler 1 sygdom
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ADeler 1 sygdom
- CEP104centrosomal protein 104Deler 1 sygdom
- CEP120centrosomal protein 120Deler 1 sygdom
- CEP290centrosomal protein 290Deler 1 sygdom
- CEP41centrosomal protein 41Deler 1 sygdom
- CSPP1centrosome and spindle pole associated protein 1Deler 1 sygdom
Træk knyttet til CPLANE1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, CPLANE1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Molar tooth sign on MRI
- Ataxia
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Intellectual disability
- Abnormal gait
- Abnormality of peripheral nerve conduction
- Degeneration of anterior horn cells
Vis 16 træk mere
- Hypoplasia of olfactory tract
- Hypothalamic hamartoma
- Abnormality of movement
- Abnormality of neuronal migration
- Agenesis of corpus callosum
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- Epilepsy
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- More grooves in brain
- Muscle twitch
- Occipital meningocele
- Periventricular nodular heterotopia
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Tremor
Abnormality of limbs
- Preaxial foot polydactyly
- Abnormality of the upper limb
- Distal upper limb amyotrophy
- Curvature of finger
- Extra little finger
- Fused toes
- Mesoaxial hand polydactyly
- Preaxial polydactyly
Vis 14 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). CPLANE1-genet: ciliogenesis and planar polarity effector complex subunit 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/cplane1
Dante Labs. CPLANE1-genet: ciliogenesis and planar polarity effector complex subunit 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/cplane1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger