Gen
SYT2
synaptotagmin 2
- HGNC 11510↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000143858↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 127833↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1q32.1
- Souřadnice
- Chromozom 1: 202 590 596–202 710 454 (GRCh38)
- Exony
- 9 exonů na 119,9 kb
- Protein
- 419 aminokyselin
- Transkript MANE Select
- ENST00000367268.5NM_177402.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SYT2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Congenital Myasthenic Syndrome
- Congenital Myasthenic Syndrome (All Types)
Umbrella term covering all congenital myasthenic syndromes, including the common CHRNE, RAPSN, DOK7 and MUSK forms.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: střední
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Many forms respond to specific medications such as pyridostigmine, salbutamol or ephedrine, and the right choice depends on the gene involved.
Jak je SYT2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 7,6 kb z 119,9 kb genu; 1 260 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SYT2
6
pozic v genu SYT2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 119,9 kb genu SYT2, včetně intronů, nikoli jen 7,6 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AGRNagrinSdílí 1 onemocnění
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- CHATcholine O-acetyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- CHRNA1cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunitSdílí 1 onemocnění
- CHRNB1cholinergic receptor nicotinic beta 1 subunitSdílí 1 onemocnění
- CHRNDcholinergic receptor nicotinic delta subunitSdílí 1 onemocnění
- CHRNEcholinergic receptor nicotinic epsilon subunitSdílí 1 onemocnění
- COL13A1collagen type XIII alpha 1 chainSdílí 1 onemocnění
- COLQcollagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesteraseSdílí 1 onemocnění
- DOK7docking protein 7Sdílí 1 onemocnění
- DPAGT1dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SYT2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SYT2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Absent reflexes
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Compound muscle action potential amplitude facilitation
- Waddling gait
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decreased sensation in extremities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Distal muscle wasting
- EMG: decremental response of compound muscle action potential to repetitive nerve stimulation
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Scoliosis
- Tired easily
- Weakness of outermost muscles
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SYT2: synaptotagmin 2. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/syt2
Dante Labs. Gen SYT2: synaptotagmin 2 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/syt2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů