Genas
SYT2
synaptotagmin 2
- HGNC 11510↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000143858↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 127833↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 1q32.1
- Koordinatės
- Chromosoma 1: 202 590 596–202 710 454 (GRCh38)
- Eksonai
- 9 eksonų per 119,9 kb
- Baltymas
- 419 aminorūgščių
- MANE Select transkriptas
- ENST00000367268.5NM_177402.5
- Lokuso tipas
- Protein-coding
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/syt2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite SYT2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Įgimtas miasteninis sindromas
- Įgimtas miasteninis sindromas (visi tipai)
Bendras terminas, apimantis visus įgimtus miasteninius sindromus, įskaitant dažnas CHRNE, RAPSN, DOK7 ir MUSK formas.
- ClinGen vertina ryšį kaip vidutinį
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Daugelis formų gerai reaguoja į specifinius vaistus, pavyzdžiui, piridostigminą, salbutamolį ar efedriną, o tinkamas pasirinkimas priklauso nuo konkretaus geno.
Kaip išdėstytas SYT2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 7,6 kb iš 119,9 kb geno; 1 260 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: SYT2
6
vietos geno SYT2 sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurioje trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 119,9 kb geno SYT2, įskaitant intronus, o ne tik 7,6 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- AGRNagrinTuri 1 bendrą būklę
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitTuri 1 bendrą būklę
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- CHATcholine O-acetyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- CHRNA1cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunitTuri 1 bendrą būklę
- CHRNB1cholinergic receptor nicotinic beta 1 subunitTuri 1 bendrą būklę
- CHRNDcholinergic receptor nicotinic delta subunitTuri 1 bendrą būklę
- CHRNEcholinergic receptor nicotinic epsilon subunitTuri 1 bendrą būklę
- COL13A1collagen type XIII alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COLQcollagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesteraseTuri 1 bendrą būklę
- DOK7docking protein 7Turi 1 bendrą būklę
- DPAGT1dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su SYT2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SYT2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Absent reflexes
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Compound muscle action potential amplitude facilitation
- Waddling gait
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decreased sensation in extremities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
Rodyti dar 4 savybių
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Distal muscle wasting
- EMG: decremental response of compound muscle action potential to repetitive nerve stimulation
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Scoliosis
- Tired easily
- Weakness of outermost muscles
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
Rodyti dar 2 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SYT2 genas: synaptotagmin 2. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/syt2
Dante Labs. SYT2 genas: synaptotagmin 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/syt2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites